Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 217,138 | A→G | Y546Y (TAT→TAC) | proS ← | prolyl‑tRNA synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 217,138 | 0 | A | G | 100.0% | 311.4 / NA | 86 | Y546Y (TAT→TAC) | proS | prolyl‑tRNA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/40); total (46/40) |
TTTATACAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTATATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATAGTGTGCGGAATACCGATCAGTTCCATATCAGCAAACATCACGCCCGGACGCTCTTTGCGGTCATCCAGCAGCACTTCGATACCT > NC_000913/217004‑217267 | tttATACAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTAtt > 1:1600251/1‑139 (MQ=255) taCAATCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGat < 1:168152/139‑1 (MQ=255) tCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATAtcgt > 2:591042/1‑139 (MQ=255) tCCATGTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATAtcgt > 2:796447/1‑139 (MQ=255) gaaaaaaaaGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTGTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTg > 1:966311/3‑139 (MQ=255) gTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTg > 1:1466143/1‑139 (MQ=255) gTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTg > 1:973138/1‑139 (MQ=255) gTAAAAAAAGGGCCCTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATCCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTg > 1:766439/1‑139 (MQ=255) cccTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACgg < 2:973138/139‑1 (MQ=255) ccTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTAtt > 2:1548987/1‑112 (MQ=255) ccTGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTAtt < 1:1548987/112‑1 (MQ=255) tGAAATTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCg < 2:590488/139‑1 (MQ=255) aaaTTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGcc < 2:1600251/139‑1 (MQ=255) aaaTTCAGGACCCTTTCTGGCATCAGCCCTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGcc < 2:966311/139‑1 (MQ=255) cccTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATa < 2:1466143/139‑1 (MQ=255) cccTTTCTGGCATCAGCCTTTAATCTGTTTCACCAGATATTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATa < 2:36436/139‑1 (MQ=255) 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tatTCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGcc > 2:1337758/1‑92 (MQ=255) tCGACGATGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATAGTGTGCGGAATACCGATCAGTTCCATATCAGCAAACATCa > 2:684431/1‑139 (MQ=255) tGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCg > 1:1476870/1‑80 (MQ=255) tGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCg < 2:1476870/80‑1 (MQ=255) tGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCg < 1:1381574/80‑1 (MQ=255) tGTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCg > 2:1381574/1‑80 (MQ=255) gTCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACGGTCGCCCAGCACAATAGTGTGCGGAATACCGATCAGTTCCATATCAGCAAACATCACGCCCGGa < 1:684431/139‑1 (MQ=255) tCACCAGTCTTAATTAACTGTTTCTCGCCGTTGCGACGATATTTGTATTCGATATCGTCGTTGTCGAGGTTACgg > 1:735767/1‑75 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |