| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 246,576 | G→A | intergenic (‑74/‑136) | dinJ ← / → yafL | antitoxin of YafQ‑DinJ toxin‑antitoxin system/putative lipoprotein and C40 family peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 246,576 | 0 | G | A | 100.0% | 99.8 / NA | 32 | intergenic (‑74/‑136) | dinJ/yafL | antitoxin of YafQ‑DinJ toxin‑antitoxin system/putative lipoprotein and C40 family peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (15/17); total (15/17) | |||||||||||
CCGCTGCCTGATTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCATTA > NC_000913/246442‑246705 | ccGCTGCCTGATTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGaataat > 1:1511898/1‑139 (MQ=255) tGATTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATaaa < 1:1286111/139‑1 (MQ=255) ttCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa > 1:1224786/1‑129 (MQ=255) ttCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa < 2:1224786/129‑1 (MQ=255) aTTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTaa < 2:1511898/139‑1 (MQ=255) tCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAAc < 1:1356542/138‑1 (MQ=255) tCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAAc > 2:1356542/1‑138 (MQ=255) cGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa > 1:504287/1‑119 (MQ=255) cGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa < 2:504287/119‑1 (MQ=255) aCGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGtt < 2:402298/139‑1 (MQ=255) aTCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATaaa < 1:353919/80‑1 (MQ=255) aTCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATaaa > 2:353919/1‑80 (MQ=255) gCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATaataat > 1:374519/1‑122 (MQ=255) gCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATaataat < 2:374519/122‑1 (MQ=255) tGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCa > 1:500920/1‑139 (MQ=255) tataTTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa < 1:872113/71‑1 (MQ=255) tataTTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa > 2:872113/1‑71 (MQ=255) ttattCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTaa > 1:944044/1‑83 (MQ=255) ttattCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTaa < 2:944044/83‑1 (MQ=255) attCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTaa > 2:363608/1‑99 (MQ=255) attCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTaa < 1:363608/99‑1 (MQ=255) cAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTg < 1:99273/81‑1 (MQ=255) cAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTg > 2:99273/1‑81 (MQ=255) gCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGa > 1:231700/1‑139 (MQ=255) cTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGaa > 2:1023838/1‑80 (MQ=255) cTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGaa < 1:1023838/80‑1 (MQ=255) aaTTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATacac > 2:118600/1‑139 (MQ=255) gTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCa < 1:118600/139‑1 (MQ=255) cAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa > 2:308909/1‑44 (MQ=255) cAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGa < 1:308909/44‑1 (MQ=255) cAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATa < 1:825064/115‑1 (MQ=255) cAGCGACAATCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATa > 2:825064/1‑115 (MQ=255) aaTCCATGAATAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCatta < 2:1116711/139‑1 (MQ=255) | CCGCTGCCTGATTCTTCAGATCTTCATCGATTCGGGCGCGAACAAACGCGTTAGCAGCCATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAATGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAACGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCATTA > NC_000913/246442‑246705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |