| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,510,886 | G→A | *419* (TAG→TAA) | yfeO → | putative ion channel protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,510,886 | 0 | G | A | 100.0% | 229.3 / NA | 71 | *419* (TAG→TAA) | yfeO | putative ion channel protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/37); total (34/37) | |||||||||||
GCAGTCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTG > NC_000913/2510752‑2511021 | gcAGTCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACaaa < 1:1409258/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 2:835091/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 2:619265/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 1:880215/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 2:59380/139‑1 (MQ=255) tGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc < 1:1262277/139‑1 (MQ=255) ccAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCtt < 2:1463457/139‑1 (MQ=255) aaTACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 1:675124/139‑1 (MQ=255) aTACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTAt > 2:1503286/1‑139 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACaaa > 2:186787/1‑117 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACaaa < 1:186787/117‑1 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc > 1:1309371/1‑125 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc > 1:797317/1‑125 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc < 2:797317/125‑1 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc < 2:1309371/125‑1 (MQ=255) cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTTCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGt > 1:888423/1‑139 (MQ=255) cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 2:1036070/127‑1 (MQ=255) cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa > 1:1036070/1‑127 (MQ=255) cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGt > 2:40022/1‑139 (MQ=255) aCCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTa < 2:618469/139‑1 (MQ=255) gctCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCga > 1:105354/1‑139 (MQ=255) tctGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 2:25421/117‑1 (MQ=255) tctGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa > 1:25421/1‑117 (MQ=255) tCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGc > 2:269528/1‑139 (MQ=255) aTGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCtt > 2:1030805/1‑139 (MQ=255) tGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCttt > 1:1566238/1‑139 (MQ=255) ttCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAcc < 2:105354/139‑1 (MQ=255) tCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCt < 2:118801/139‑1 (MQ=255) ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct > 2:211534/1‑92 (MQ=255) ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 1:211534/92‑1 (MQ=255) ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGCTCAATCGTCCGAAGAAACATCCACCCCACGATAACGTTTAACAAGAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATCGCGATGATACGGGGCTTTACCTc > 1:1061516/1‑139 (MQ=255) cGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc < 1:1503286/139‑1 (MQ=255) ggCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTccc > 1:1578564/1‑139 (MQ=255) ggCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCAGGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGTTACGGGGCTTTACCTcc < 1:922579/133‑1 (MQ=255) ggCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc > 2:922579/1‑133 (MQ=255) ttattaGCAGGTAAGCCGATGATGTTGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCTCCGTAATATTg > 2:36536/1‑139 (MQ=255) aGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 1:1360488/119‑1 (MQ=255) aGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc > 2:1360488/1‑119 (MQ=255) gCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTaa > 1:1303112/1‑90 (MQ=255) gCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTaa < 2:1303112/90‑1 (MQ=255) gTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATa > 2:463070/1‑103 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |