| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,549,755 | C→T | E106K (GAA→AAA) | malQ ← | 4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,549,755 | 0 | C | T | 100.0% | 134.8 / NA | 42 | E106K (GAA→AAA) | malQ | 4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (19/23); total (19/23) | |||||||||||
TAAAGCTGAACGCAGGCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTGC > NC_000913/3549619‑3549883 | taAAGCTGAACGCAGGCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCGGCGTGTGATAACCTTTCg > 2:1080661/1‑139 (MQ=255) aaCGCAGGCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTtc > 2:180616/1‑139 (MQ=255) aaCGCAGGCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTtc > 2:486339/1‑139 (MQ=255) ggCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGt < 1:180616/139‑1 (MQ=255) cacaGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGa < 1:1221656/139‑1 (MQ=255) ttGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTg > 2:735036/1‑139 (MQ=255) gTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc < 1:1080661/139‑1 (MQ=255) gTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc < 1:735036/139‑1 (MQ=255) ttATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccc < 2:1592822/139‑1 (MQ=255) aTTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccc < 2:1454006/139‑1 (MQ=255) ttCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCg > 1:1220780/1‑139 (MQ=255) gCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCACTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAGCGCTTTGCCCCCCGTTAc < 1:833002/139‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACAt < 1:1333392/139‑1 (MQ=255) cGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATgg > 1:402153/1‑139 (MQ=255) ccTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAAT‑ACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGc < 1:410818/97‑1 (MQ=255) ccTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAAT‑ACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGc > 2:410818/1‑97 (MQ=255) gCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCttt > 2:725371/1‑139 (MQ=255) cGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATgg < 1:447057/128‑1 (MQ=255) cGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATgg > 2:447057/1‑128 (MQ=255) tAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCg > 2:679099/1‑139 (MQ=255) aaCAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGt < 2:83311/139‑1 (MQ=255) aCAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGtt < 1:486339/139‑1 (MQ=255) cAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTc < 1:1242640/139‑1 (MQ=255) aGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGCCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTcc > 2:966561/1‑139 (MQ=255) cGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCctt > 2:177539/1‑139 (MQ=255) aTCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcagca < 2:402153/139‑1 (MQ=255) cACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCagcagc < 1:679099/139‑1 (MQ=255) cACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCagcagc < 1:177539/139‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCtt < 2:982201/54‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCtt > 1:982201/1‑54 (MQ=255) cgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgccgc < 2:1220780/139‑1 (MQ=255) gcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCt < 2:354436/139‑1 (MQ=255) tggccgtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGc < 1:966561/135‑1 (MQ=255) cTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccacc > 1:1238317/1‑139 (MQ=255) ggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccaccacc < 2:822/139‑1 (MQ=255) tgtCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccc > 2:1529884/1‑58 (MQ=255) tgtCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccc < 1:1529884/58‑1 (MQ=255) tgtCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGc > 2:477912/1‑139 (MQ=255) tgtCAGCGTGTGATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGc > 1:1095081/1‑139 (MQ=255) tgATAACCTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTGc > 1:744741/1‑139 (MQ=255) ccTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc < 2:608180/37‑1 (MQ=255) ccTTTCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc > 1:608180/1‑37 (MQ=255) | TAAAGCTGAACGCAGGCACCCCACAGCTTTTGTTTATTCAGCAACGCCTGCGGTTCGTAACAGCGTTTCGGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTGC > NC_000913/3549619‑3549883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |