| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 524,158 | C→T | L300L (CTG→TTG) | rhsD → | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 524,158 | 0 | C | T | 100.0% | 67.6 / NA | 22 | L300L (CTG→TTG) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/12); total (10/12) | |||||||||||
TGCGGAAGAGGCCCGCACCTCTTCGCTATCTTCTTCTGACAGTTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGCTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGAAGCCGGTGAACTGCTGGCGGTATATGACCGCAGCAATACGCAGGTGCGCGCTTTCACGTATGACGC > NC_000913/524025‑524291 | tGCGGAAGAGGCCCGCACCTCTTCGCTATCTTCTTCTGACAGTTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATg > 2:345607/1‑139 (MQ=255) cGCACCTCTTCGCTATCTTCTTCTGACAGTTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCAt < 1:592366/139‑1 (MQ=255) ttCGCTATCTTCTTCTGACAGTTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGgag > 2:88270/1‑139 (MQ=255) ccGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTg < 1:458867/139‑1 (MQ=255) ctctctCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTa < 1:528857/139‑1 (MQ=255) tctctcAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTac < 1:20694/139‑1 (MQ=255) tctctcAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTac < 1:13162/139‑1 (MQ=255) cctcagcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGCGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATAc > 1:660191/1‑139 (MQ=255) cctcagcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTac > 1:303641/1‑131 (MQ=255) cctcagcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTac < 2:303641/131‑1 (MQ=255) cctcagcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATAc > 1:720959/1‑139 (MQ=255) agcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTa > 2:635523/1‑126 (MQ=255) agcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTa < 1:635523/126‑1 (MQ=255) agcGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGaa > 1:673741/1‑139 (MQ=255) cccGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGAAGCCGGTg < 2:733390/139‑1 (MQ=255) gACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCa < 1:80848/68‑1 (MQ=255) gACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCa > 2:80848/1‑68 (MQ=255) ggCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGc > 1:56817/1‑74 (MQ=255) ggCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGc < 2:56817/74‑1 (MQ=255) cccGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGAc > 2:161125/1‑45 (MQ=255) cccGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGTTGATGCACGAc < 1:161125/45‑1 (MQ=255) cggTGTGGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGAAGCCGGTGAACTGCTGGCGGTATATGACCGCAGCAATACGCAGGTGCGCGCTTTCACGTATGa < 1:137831/139‑1 (MQ=255) tgtgGTTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGAAGCCGGTGAACTGCTGGCGGTATATGACCGCAGCAATACGCAGGTGCGCGCTTTCACGTATGAcgc > 2:87134/1‑139 (MQ=255) | TGCGGAAGAGGCCCGCACCTCTTCGCTATCTTCTTCTGACAGTTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCGCCTTTCGGCGGTGTGGCTGATGCACGACCCGGCATACCCGGAGAGCCTGCCCGCTGCGCCACTGGTGCGGTACACGTATACGGAAGCCGGTGAACTGCTGGCGGTATATGACCGCAGCAATACGCAGGTGCGCGCTTTCACGTATGACGC > NC_000913/524025‑524291 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |