| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,841,897 | G→A | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) |
nudG → ynjH ← |
CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,841,897 | 0 | G | A | 100.0% | 83.1 / NA | 27 | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) | nudG ynjH | CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (17/10); total (17/10) | |||||||||||
CAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACT > NC_000913/1841784‑1841996 | cAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTg > 1:110062/1‑139 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtc < 1:759122/128‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtc > 2:759122/1‑128 (MQ=255) gcTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAtt > 2:386476/1‑139 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCt > 2:545385/1‑139 (MQ=255) ccTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTc > 2:140630/1‑139 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCt < 1:545385/139‑1 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt < 1:764660/113‑1 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt > 2:764660/1‑113 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAt > 2:707231/1‑139 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAt > 2:266749/1‑139 (MQ=255) tCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 1:261662/139‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaa > 1:279919/1‑139 (MQ=255) gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaata > 2:1855/1‑139 (MQ=255) tgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAtttt > 1:686890/1‑139 (MQ=255) attattAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaaa > 2:357465/1‑139 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 2:424721/139‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa < 1:293925/45‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa > 2:293925/1‑45 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 1:357465/139‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt > 2:603874/1‑139 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATCAtt < 1:16147/102‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAtt > 2:16147/1‑102 (MQ=255) aCGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGt > 2:229202/1‑63 (MQ=255) aCGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGt < 1:229202/63‑1 (MQ=255) ccgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCtt > 2:618572/1‑71 (MQ=255) ccgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCtt < 1:618572/71‑1 (MQ=255) | CAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACT > NC_000913/1841784‑1841996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |