| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 28,269 | C→T | intergenic (+62/‑105) | rihC → / → dapB | ribonucleoside hydrolase 3/dihydrodipicolinate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 28,269 | 0 | C | T | 100.0% | 63.0 / NA | 22 | intergenic (+62/‑105) | rihC/dapB | ribonucleoside hydrolase 3/dihydrodipicolinate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/10); total (12/10) | |||||||||||
GTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACATCC > NC_000913/28139‑28392 | gTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTAt > 2:286603/1‑139 (MQ=255) ggCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCa > 1:395698/1‑139 (MQ=255) tCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCt < 2:83118/139‑1 (MQ=255) tgAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCa > 1:319908/1‑139 (MQ=255) tgAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCa < 1:112499/139‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGttt < 2:115619/139‑1 (MQ=255) gCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCAtt > 1:351603/1‑101 (MQ=255) gCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCAtt < 2:351603/101‑1 (MQ=255) cacaTGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGc > 1:379020/1‑139 (MQ=255) tGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAAt > 2:398377/1‑139 (MQ=255) tGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAAt > 2:478571/1‑139 (MQ=255) tGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACaa < 1:286603/139‑1 (MQ=255) tGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACaa < 2:319908/139‑1 (MQ=255) cATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAag < 1:478571/139‑1 (MQ=255) gCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAgaga > 2:47417/1‑139 (MQ=255) cAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGaa > 1:276550/1‑139 (MQ=255) tCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGTGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCa < 1:740944/139‑1 (MQ=255) cTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAAt < 1:565004/41‑1 (MQ=255) cTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAAt > 2:565004/1‑41 (MQ=255) aTGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCg < 1:516298/74‑1 (MQ=255) aTGCCTTTCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCg > 2:516298/1‑74 (MQ=255) tCACTGATATCCCTCTCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACATcc > 2:334109/1‑139 (MQ=255) | GTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACATCC > NC_000913/28139‑28392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |