| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 323,355 | C→T | P340S (CCA→TCA) | ykgF → | ferridoxin‑like LutB family protein, putative electron transport chain YkgEFG component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 323,355 | 0 | C | T | 100.0% | 114.3 / NA | 37 | P340S (CCA→TCA) | ykgF | ferridoxin‑like LutB family protein, putative electron transport chain YkgEFG component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (18/19); total (18/19) | |||||||||||
AGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTG > NC_000913/323236‑323486 | aGGTGCTGTCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGCGCGGTGATTtc > 1:500672/1‑139 (MQ=255) tGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTcc > 1:721251/1‑139 (MQ=255) gCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCg < 2:89283/139‑1 (MQ=255) gCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTAc > 1:402202/1‑139 (MQ=255) tgctgcGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattt > 2:680436/1‑139 (MQ=255) cTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat < 1:680436/139‑1 (MQ=255) tGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt < 2:396245/139‑1 (MQ=255) ggCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGc < 1:2309/139‑1 (MQ=255) ggCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGc < 2:402202/139‑1 (MQ=255) ggCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGc < 1:72144/139‑1 (MQ=255) aaTACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGca < 1:213727/139‑1 (MQ=255) aaTACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAAGTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGca < 1:370310/139‑1 (MQ=255) cTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGctc < 1:199786/127‑1 (MQ=255) cTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACGTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGctc > 2:199786/1‑127 (MQ=255) ttGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTCTTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCt < 2:500672/139‑1 (MQ=255) ttGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTGTATGCACAGCt > 1:499344/1‑139 (MQ=255) tGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGTTATGGCGCTATTTATCTAGGGTCCCTTGGTGCGGGCATTTCTCCGCTACTTCGCGGCTATAAAGAGTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCtt > 2:17979/1‑139 (MQ=255) gTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTtg > 1:729566/1‑139 (MQ=255) cGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt < 1:670175/105‑1 (MQ=255) cGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt > 2:670175/1‑105 (MQ=255) atatTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAATATTTACCCTACGCCTGCTCTATATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTcc < 2:499344/139‑1 (MQ=255) tGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTg < 1:277517/139‑1 (MQ=255) ggCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGca < 2:72807/112‑1 (MQ=255) ggCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGca > 1:72807/1‑112 (MQ=255) gCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCg > 1:124129/1‑139 (MQ=255) tGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt < 1:4792/80‑1 (MQ=255) tGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagatt > 2:4792/1‑80 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat > 2:217408/1‑67 (MQ=255) tATTTATCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat < 1:217408/67‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTCAATTGGTGCGGTTATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTcc < 2:616598/109‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTcc > 1:616598/1‑109 (MQ=255) tCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTg > 2:40400/1‑139 (MQ=255) tCCAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCAACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTg > 1:480628/1‑139 (MQ=255) ccAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat < 1:76167/60‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTAtaaagattttaaagat > 2:76167/1‑60 (MQ=255) ccAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGcc < 1:723666/72‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGcc > 2:723666/1‑72 (MQ=255) | AGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTG > NC_000913/323236‑323486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |