| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 328,682 | C→T | A18T (GCC→ACC) | betB ← | betaine aldehyde dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 328,682 | 0 | C | T | 100.0% | 67.7 / NA | 22 | A18T (GCC→ACC) | betB | betaine aldehyde dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/14); total (8/14) | |||||||||||
CGACGCCCAGATTTTTTGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGGTTT > NC_000913/328548‑328805 | cGACGCCCAGATTTTTTGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTATCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAg > 2:245796/1‑139 (MQ=255) aGATTTTTTGCCCCTGCTGGGGGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTATCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAacc < 1:245796/139‑1 (MQ=255) aGATTTTTTGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAacc > 2:286497/1‑139 (MQ=255) aGATTTTTTGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAacc < 1:610230/139‑1 (MQ=255) ttttttGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAaccacc < 1:738095/139‑1 (MQ=255) ttttttGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAaccacc < 1:286497/139‑1 (MQ=255) ttttttGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAaccacc < 1:655766/139‑1 (MQ=255) tttttGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAAccacca < 2:712623/139‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATaa < 2:593336/139‑1 (MQ=255) tCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACa < 2:743508/139‑1 (MQ=255) cgcgCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTctcc > 2:264634/1‑139 (MQ=255) cggcCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAAt < 1:264634/139‑1 (MQ=255) tCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGAt > 1:151652/1‑139 (MQ=255) ccAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCt < 1:609105/139‑1 (MQ=255) gCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAg < 2:506669/139‑1 (MQ=255) tACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTg < 1:25312/84‑1 (MQ=255) tACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTg > 2:25312/1‑84 (MQ=255) cGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGt > 2:565151/1‑139 (MQ=255) tcGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAaccacc > 2:689143/1‑38 (MQ=255) tcGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAaccacc < 1:689143/38‑1 (MQ=255) cGAAGGTGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAgcgc < 1:227019/139‑1 (MQ=255) tGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGGttt > 1:258555/1‑139 (MQ=255) tGCGACCGCTGGTGGTGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGGgtt > 1:652708/1‑139 (MQ=255) | CGACGCCCAGATTTTTTGCCCCTGCTGGGCGCTTTTCACGGCGCGATCGACATCCTCGCGCCCGGCGGCCTGCACGGTCGCCAGCACGTTACCGTTGGCCGGGTTAATGGTCTCGAAGGTGCGACCGCTGGTGGCGGAGGTATAACCACCATGTATATAAAGCTGCTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGGTTT > NC_000913/328548‑328805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |