| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,292,149 | A→G | Y213C (TAC→TGC) | nrfE → | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,292,149 | 0 | A | G | 100.0% | 80.2 / NA | 24 | Y213C (TAC→TGC) | nrfE | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (10/14); total (10/14) | |||||||||||
TGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCTGACACGCCAGCGGGGGATTTTTTGCCACTGGT > NC_000913/4292026‑4292283 | tGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTg < 2:557723/139‑1 (MQ=255) cTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGggcg < 2:569941/139‑1 (MQ=255) gAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCtgg < 1:701347/139‑1 (MQ=255) gTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCtggtg < 2:419432/139‑1 (MQ=255) cgcgGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTATCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGCGGATCATCCTCGGTTGCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTggg < 1:490892/139‑1 (MQ=255) cgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCt > 1:291947/1‑101 (MQ=255) cgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCt < 2:291947/101‑1 (MQ=255) gTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGc < 2:346240/139‑1 (MQ=255) gCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCct < 1:67413/139‑1 (MQ=255) aTTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCt < 2:302870/139‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg > 2:90096/1‑135 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg < 1:90096/135‑1 (MQ=255) gAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCgctg > 2:85857/1‑130 (MQ=255) gAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCgctg < 1:85857/130‑1 (MQ=255) gAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGt > 1:174577/1‑139 (MQ=255) gAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGAGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCCTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGt > 1:513590/1‑139 (MQ=255) ttAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg > 2:233403/1‑105 (MQ=255) ttAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg < 1:233403/105‑1 (MQ=255) aCGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCctc > 2:39806/1‑89 (MQ=255) aCGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCctc < 1:39806/89‑1 (MQ=255) ccTCGGTTCCTGGTGGGCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCTGACACGCCAGCggggg > 2:704387/1‑139 (MQ=255) gCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg > 2:230741/1‑72 (MQ=255) gCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTgg < 1:230741/72‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCTGACACGCCAGCGGGGGATTTTTTGCCACTGGt > 1:140483/1‑139 (MQ=255) | TGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCATCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCTGACACGCCAGCGGGGGATTTTTTGCCACTGGT > NC_000913/4292026‑4292283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |