| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 788831 = | 0 (0.000) | 107 (1.570) | 57/204 | 0.1 | 97.3% | coding (7/1041 nt) coding (1149/1149 nt) |
galM galK |
aldose 1‑epimerase, type‑1 mutarotase, galactose mutarotase galactokinase |
| ? | NC_000913 | 3742633 = | 6 (0.090) | intergenic (‑101/‑100) | yiaJ/yiaK | transcriptional repressor for the yiaKLMNO‑lyxK‑sgbHUE operon/2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase, NADH‑dependent | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAA > NC_000913/3742494‑3742770 | cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatc > 2:517014/1‑139 (MQ=255) tctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcct > 1:1330736/1‑137 (MQ=255) cGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctgtt < 2:1180730/139‑6 (MQ=255) tttttttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctgttgacaatt > 1:864777/1‑127 (MQ=255) gcgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGt > 2:1715712‑M2/127‑139 (MQ=255) ctgatcccggaagagctggtgcctgctgtacagcaagctgtcgctgaacaaaatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaa > 1:1654941‑M2/124‑139 (MQ=255) ctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaa > 1:1212875‑M2/124‑139 (MQ=255) atcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaaaaa < 2:1302535‑M2/19‑1 (MQ=255) ccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTg < 1:1715712‑M2/22‑1 (MQ=255) cggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGa < 1:619213‑M2/23‑1 (MQ=255) ggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:1703686‑M2/24‑1 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaaaaa > 1:64671‑M2/111‑129 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGata > 2:374591‑M2/111‑139 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGata > 2:1355452‑M2/111‑139 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 1:1215602‑M2/109‑117 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 2:1215602‑M2/9‑1 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatata > 2:221638‑M2/109‑139 (MQ=255) gcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGa > 1:66343‑M2/104‑139 (MQ=255) agctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 1:896616‑M2/9‑1 (MQ=255) agctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 2:896616‑M2/89‑97 (MQ=255) gctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 2:1366506‑M2/88‑96 (MQ=255) tgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:1184517‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 2:1184517‑M2/86‑109 (MQ=255) tcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCt < 2:630523‑M2/10‑1 (MQ=255) tcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCt > 1:630523‑M2/84‑93 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:407808‑M2/24‑1 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:30777‑M2/24‑1 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:407808‑M2/68‑91 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:30777‑M2/68‑91 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaaaa > 1:148009‑M2/68‑139 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaaaa > 2:1014162‑M2/68‑139 (MQ=255) aaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCg < 1:1355452‑M2/76‑1 (MQ=255) aaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCGTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCg < 2:1179916‑M2/76‑1 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctgtt > 2:1023576/1‑62 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctgtt < 1:1023576/67‑6 (MQ=255) aaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 2:734772‑M2/63‑71 (MQ=255) aaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 1:734772‑M2/9‑1 (MQ=255) aaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGa > 1:529347‑M2/63‑139 (MQ=255) aacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt < 2:66343‑M2/78‑1 (MQ=255) gtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATAaaaa > 2:845886‑M2/57‑139 (MQ=255) agagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 1:374591‑M2/90‑1 (MQ=255) gactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCata < 1:1448627‑M2/52‑1 (MQ=255) gactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCata > 2:1448627‑M2/47‑98 (MQ=255) gactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGaa > 2:257217‑M2/47‑139 (MQ=255) actttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:1364907‑M2/24‑1 (MQ=255) actttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:1364907‑M2/46‑69 (MQ=255) actttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatat > 1:845978‑M2/46‑75 (MQ=255) actttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatat < 2:845978‑M2/30‑1 (MQ=255) actttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 1:1046867‑M2/81‑1 (MQ=255) tttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc < 1:604466‑M2/96‑1 (MQ=255) tttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGaaa > 2:833476‑M2/42‑79 (MQ=255) gtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATg < 2:529347‑M2/103‑1 (MQ=255) tgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa < 1:346020‑M2/85‑1 (MQ=255) tgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa > 2:346020‑M2/34‑118 (MQ=255) tgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGaaa > 1:200585‑M2/34‑139 (MQ=255) taaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 2:1384448‑M2/9‑1 (MQ=255) taaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 1:1384448‑M2/32‑40 (MQ=255) catcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaaa < 1:1573478‑M2/17‑1 (MQ=255) catcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaaa > 2:1573478‑M2/27‑43 (MQ=255) catcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACAt < 1:1014162‑M2/113‑1 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGt > 1:32196‑M2/25‑45 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaaaaa > 2:14296‑M2/25‑97 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaaaaa < 1:14296‑M2/73‑1 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaa < 1:1249558‑M2/83‑1 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaa > 2:1249558‑M2/25‑107 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAgg > 1:1440245‑M2/25‑115 (MQ=255) 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tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCAATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGaa < 1:1152777‑M2/105‑1 (MQ=255) cacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTTCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:1668570‑M2/24‑47 (MQ=255) caaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 2:148009‑M2/118‑1 (MQ=255) caggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 2:316647‑M2/90‑1 (MQ=255) caggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg > 1:316647‑M2/15‑104 (MQ=255) aggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 1:1563727‑M2/14‑121 (MQ=255) aggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt < 2:1563727‑M2/108‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |