Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 583489 583618 130 22 [18] [15] 22 tfaX/appY pseudogene, DLP12 prophage,Phage or Prophage Related/global transcriptional activator, DLP12 prophage

TTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAA  >  NC_000913/583533‑583757
                                                                                      |                                                                                                                                          
tttAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATAATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        >  1:1138284/1‑139 (MQ=255)
               aaTTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTAACAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGAt                                                                         <  2:1138284/139‑1 (MQ=255)
                                              tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        <  2:525350/93‑1 (MQ=255)
                                              tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAAt                                          >  1:1657607/1‑139 (MQ=255)
                                              tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTAGTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        >  1:525350/1‑93 (MQ=255)
                                                tataAAAATATAAATGCCCATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCa                                        >  1:1175694/1‑139 (MQ=255)
                                                            aaTGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAAtt                            <  2:1657607/139‑1 (MQ=255)
                                                                     catcCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        >  2:994543/1‑70 (MQ=255)
                                                                     catcCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        <  1:994543/70‑1 (MQ=255)
                                                                        ccTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGgaga                >  1:429139/1‑139 (MQ=255)
                                                                                 gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa                                                                              <  1:959043/68‑1 (MQ=255)
                                                                                 gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa                                                                              >  2:959043/1‑68 (MQ=255)
                                                                                  aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt      >  1:941369/1‑139 (MQ=255)
                                                                                  aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt      >  1:526720/1‑139 (MQ=255)
                                                                                  aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt      >  2:732221/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt                                                                                        <  1:1228317/53‑1 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa  >  1:969208/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa  >  1:751998/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa  >  2:1391574/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa  >  1:1730150/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa  >  2:550121/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAAGTTTATGAt                                                                                        >  2:1228317/1‑53 (MQ=255)
                                                                                      |                                                                                                                                          
TTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAA  >  NC_000913/583533‑583757

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: