Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 583489 | 583618 | 130 | 22 [18] | [15] 22 | tfaX/appY | pseudogene, DLP12 prophage,Phage or Prophage Related/global transcriptional activator, DLP12 prophage |
TTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAA > NC_000913/583533‑583757 | tttAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATAATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt > 1:1138284/1‑139 (MQ=255) aaTTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTAACAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGAt < 2:1138284/139‑1 (MQ=255) tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt < 2:525350/93‑1 (MQ=255) tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAAt > 1:1657607/1‑139 (MQ=255) tgtATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTAGTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt > 1:525350/1‑93 (MQ=255) tataAAAATATAAATGCCCATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCa > 1:1175694/1‑139 (MQ=255) aaTGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAAtt < 2:1657607/139‑1 (MQ=255) catcCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt > 2:994543/1‑70 (MQ=255) catcCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt < 1:994543/70‑1 (MQ=255) ccTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGgaga > 1:429139/1‑139 (MQ=255) gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa < 1:959043/68‑1 (MQ=255) gATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGa > 2:959043/1‑68 (MQ=255) aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt > 1:941369/1‑139 (MQ=255) aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt > 1:526720/1‑139 (MQ=255) aTTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGt > 2:732221/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGAt < 1:1228317/53‑1 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa > 1:969208/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa > 1:751998/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa > 2:1391574/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa > 1:1730150/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCaa > 2:550121/1‑139 (MQ=255) tgtATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAAGTTTATGAt > 2:1228317/1‑53 (MQ=255) | TTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAAACTATAATTTTGTGTATAAAAATATAAATGCACATCATCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGCTCCGTAGTTTTCATCTGTCAATCATTTGATTTAATTATAAACAGGAGAGTTATCTCGTTCAA > NC_000913/583533‑583757 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |