| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,154,109 | G→A | *270* (TAG→TAA) | pabC → | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,154,109 | 0 | G | A | 100.0% | 156.2 / NA | 48 | *270* (TAG→TAA) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/25); total (23/25) | |||||||||||
TCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTA > NC_000913/1153975‑1154238 | tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCAt > 1:638037/1‑139 (MQ=255) gTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGAGCGCCCGAATTAATCAt > 1:1186428/1‑139 (MQ=255) tGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaa > 1:135169/1‑139 (MQ=255) aggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa < 2:135169/139‑1 (MQ=255) aggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa < 2:638037/139‑1 (MQ=255) ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGAt < 2:1186428/139‑1 (MQ=255) ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATaa < 1:509448/139‑1 (MQ=255) ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGACGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATaa < 1:509447/139‑1 (MQ=255) tAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa > 1:1635729/1‑109 (MQ=255) tAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa < 2:1635729/109‑1 (MQ=255) tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAgtg < 2:769665/103‑1 (MQ=255) tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAgtg > 1:769665/1‑103 (MQ=255) tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGa > 1:1587835/1‑110 (MQ=255) tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGa < 2:1587835/110‑1 (MQ=255) tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa > 1:254021/1‑97 (MQ=255) tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa < 2:254021/97‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa > 2:1356377/1‑85 (MQ=255) ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaaaa < 1:1356377/85‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg > 1:1645637/1‑139 (MQ=255) ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 2:1277613/139‑1 (MQ=255) tgtgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 2:1217533/139‑1 (MQ=255) tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCAt > 2:783156/1‑74 (MQ=255) tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCAt < 1:783156/74‑1 (MQ=255) tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaa > 2:877871/1‑79 (MQ=255) tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGaaaa < 1:877871/79‑1 (MQ=255) cGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 2:1502365/1‑89 (MQ=255) cGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc < 1:1502365/89‑1 (MQ=255) gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATc > 1:1430916/1‑101 (MQ=255) gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 1:738864/123‑1 (MQ=255) gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa > 2:738864/1‑123 (MQ=255) gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAAGCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATc < 2:1430916/101‑1 (MQ=255) atatTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 1:1360072/101‑1 (MQ=255) atatTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg > 2:1360072/1‑101 (MQ=255) atatTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGc > 2:1469534/1‑139 (MQ=255) atTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGAt > 1:599456/1‑54 (MQ=255) atTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGAt < 2:599456/54‑1 (MQ=255) tAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTAt < 1:1714302/47‑1 (MQ=255) tAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTAt > 2:1714302/1‑47 (MQ=255) aGCCCCACTTTTT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGtt < 2:1028917/44‑1 (MQ=255) aGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGtt > 1:1028917/1‑44 (MQ=255) aGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCa < 2:1645637/139‑1 (MQ=255) cccACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 2:50831/64‑1 (MQ=255) cccACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg > 1:50831/1‑64 (MQ=255) cTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAgtgt < 1:1641179/36‑1 (MQ=255) cTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAgtgt > 2:1641179/1‑36 (MQ=255) cccGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 2:267507/77‑1 (MQ=255) cccGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg > 1:267507/1‑77 (MQ=255) cccGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTa > 1:588355/1‑139 (MQ=255) | TCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGT‑‑GAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTA > NC_000913/1153975‑1154238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |