| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,366,935 | C→T | *326* (TAG→TAA) | pspF ← | psp operon transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,366,935 | 0 | C | T | 99.0% | 327.4 / NA | 102 | *326* (TAG→TAA) | pspF | psp operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (53/48); total (54/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAA > NC_000913/1366807‑1367069 | aGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt > 2:46195/1‑139 (MQ=255) gCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTg > 2:124012/1‑139 (MQ=255) gCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACAACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTg > 1:901975/1‑139 (MQ=255) cccAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 1:950439/139‑1 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt < 2:366852/124‑1 (MQ=255) aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt > 1:366852/1‑124 (MQ=255) cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg > 2:316400/1‑139 (MQ=255) cAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 1:898438/139‑1 (MQ=255) tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgat > 2:1192504/1‑139 (MQ=255) tgcgctgcgcTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACt > 1:864965/1‑131 (MQ=255) tgcgctgcgcTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACt < 2:864965/131‑1 (MQ=255) ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTa > 1:266266/1‑139 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca > 1:490605/1‑102 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 2:490605/102‑1 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 2:821528/109‑1 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 1:821528/1‑109 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa < 2:70546/112‑1 (MQ=255) gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGaa > 1:70546/1‑112 (MQ=255) tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatga > 1:1430724/1‑116 (MQ=255) tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatga > 1:370723/1‑116 (MQ=255) tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatga < 2:1430724/116‑1 (MQ=255) tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatga < 2:370723/116‑1 (MQ=255) cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 1:879773/1‑104 (MQ=255) cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 2:879773/104‑1 (MQ=255) cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg > 2:380474/1‑139 (MQ=255) cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg > 1:1581572/1‑139 (MQ=255) cAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcg < 2:1581572/139‑1 (MQ=255) aaCGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcg < 1:1265985/139‑1 (MQ=255) aaCGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcg < 2:150569/139‑1 (MQ=255) cgacgTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcgcg < 1:46195/139‑1 (MQ=255) acgTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 2:901975/139‑1 (MQ=255) acgTATTGACTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTTCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt > 2:1273088/1‑139 (MQ=255) cgTATTGATTATGTATGCCGAATAAATCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtg < 2:1245407/103‑1 (MQ=255) cgTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtg > 1:1245407/1‑103 (MQ=255) aTTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTg > 2:1727306/1‑139 (MQ=255) ttATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTtat < 2:266266/139‑1 (MQ=255) atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 1:1638470/96‑1 (MQ=255) atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg > 2:1638470/1‑96 (MQ=255) atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 2:820585/106‑1 (MQ=255) atgtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 1:820585/1‑106 (MQ=255) gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATAttt > 2:1159799/1‑139 (MQ=255) gtatgCCGAATAAAGCATTCACGCAGCATCCGGCAAGTTGTATCGCTCACCTTCGTTAAACCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACACCAGTAACTCATCCGCGCGATTCTGGTTATAttt > 2:441414/1‑139 (MQ=255) tgCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc < 1:124012/139‑1 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 1:1102437/1‑80 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 2:1102437/80‑1 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 1:1652771/1‑139 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 1:1369093/1‑139 (MQ=255) ccGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCtt > 1:1406218/1‑139 (MQ=255) cGAATAATGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt < 1:1172897/60‑1 (MQ=38) cGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTACCttg < 1:380474/139‑1 (MQ=255) cGAATAAAGCATTCACGCCGCATCAGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGt > 2:1172897/1‑60 (MQ=39) aaTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttgtt > 2:289355/1‑139 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 1:259082/76‑1 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 2:259082/1‑76 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAcccc > 2:700605/1‑98 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAcccc < 1:700605/98‑1 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 2:23951/1‑95 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 1:595417/1‑95 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:23951/95‑1 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 2:595417/95‑1 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttgttg < 2:1652771/139‑1 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttgttg > 2:1170539/1‑139 (MQ=255) aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCC‑TGTTGc > 2:1729388/1‑139 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 2:1085819/65‑1 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGtt < 1:325387/83‑1 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGtt > 2:325387/1‑83 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc < 2:400212/124‑1 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc > 1:400212/1‑124 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAg > 2:1309687/1‑139 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCCGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAg > 2:1223119/1‑139 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg > 1:1085819/1‑65 (MQ=255) cACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGt < 1:1192504/139‑1 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gcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcgcg < 1:1553541/99‑1 (MQ=255) gcATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTgcagc < 1:316400/139‑1 (MQ=255) tCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAAc > 2:29646/1‑139 (MQ=255) ttGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:449647/67‑1 (MQ=255) ttGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 2:449647/1‑67 (MQ=255) gTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctg < 1:891022/139‑1 (MQ=255) tATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctgc < 1:441414/139‑1 (MQ=255) aTTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctgct < 2:1082003/139‑1 (MQ=255) aTTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCctgct < 1:1727306/139‑1 (MQ=255) ttGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat < 2:831048/54‑1 (MQ=255) ttGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat > 1:831048/1‑54 (MQ=255) cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt > 1:824310/1‑82 (MQ=255) cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt < 2:610428/82‑1 (MQ=255) cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt > 1:610428/1‑82 (MQ=255) cTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTGAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt < 2:824310/82‑1 (MQ=255) cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 1:1668711/35‑1 (MQ=255) cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg > 2:1668711/1‑35 (MQ=255) cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc < 1:150913/92‑1 (MQ=255) cTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc > 2:150913/1‑92 (MQ=255) ttCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGaaa < 1:1223119/139‑1 (MQ=255) | AGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAA > NC_000913/1366807‑1367069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |