Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,627,124 | T→C | D86G (GAT→GGT) | dcp ← | dipeptidyl carboxypeptidase II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,627,124 | 0 | T | C | 100.0% | 257.0 / NA | 69 | D86G (GAT→GGT) | dcp | dipeptidyl carboxypeptidase II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/33); total (36/33) |
CCCAGGGATTCACGGCGCTGCCAGACAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCATCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAGGCATTTGCGGGTTAAGCGCGATGGCAG > NC_000913/1627001‑1627250 | cccAGGGATTCACGGCGCTGCCAGACAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGcgccg > 1:1292016/1‑139 (MQ=255) cGGCGCTGCCAGACAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaa > 2:1535753/1‑139 (MQ=255) cAGACAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGc < 2:1292016/139‑1 (MQ=255) cAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGt < 1:690458/106‑1 (MQ=255) cAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGt > 2:690458/1‑106 (MQ=255) gTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGt > 1:420664/1‑139 (MQ=255) tCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAAtt < 1:736229/126‑1 (MQ=255) tCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAAtt > 2:736229/1‑126 (MQ=255) agataTCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc < 2:648779/139‑1 (MQ=255) gataTCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc < 1:1152638/138‑1 (MQ=255) gataTCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc > 2:1152638/1‑138 (MQ=255) tatCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAg < 2:420664/139‑1 (MQ=255) atCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa < 1:250664/92‑1 (MQ=255) atCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa > 2:250664/1‑92 (MQ=255) ttAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa > 2:1451028/1‑88 (MQ=255) ttAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa < 1:1451028/88‑1 (MQ=255) ttAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAg < 2:1304705/128‑1 (MQ=255) ttAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAg > 1:1304705/1‑128 (MQ=255) ttAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAg > 1:533867/1‑139 (MQ=255) tAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTAt > 1:637457/1‑63 (MQ=255) tAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTAt < 2:637457/63‑1 (MQ=255) gCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc < 2:94949/128‑1 (MQ=255) gCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc > 1:94949/1‑128 (MQ=255) ccAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa < 1:158020/80‑1 (MQ=255) ccAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa > 2:158020/1‑80 (MQ=255) ccAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTAtt > 1:46432/1‑139 (MQ=255) ccAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTAtt > 1:1228562/1‑139 (MQ=255) ccAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTAtt > 2:1634604/1‑139 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGt < 1:1707184/54‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGt > 2:1707184/1‑54 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTa > 2:1707328/1‑55 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTa > 2:1350157/1‑55 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTa < 1:1350157/55‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTa < 1:1707328/55‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGc < 1:665674/83‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGc > 2:665674/1‑83 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAAcgc > 1:871781/1‑92 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAAcgc < 2:871781/92‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTcc > 1:754327/1‑118 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTcc < 2:754327/118‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAg > 1:1565489/1‑120 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAg < 2:1565489/120‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTAttgtt < 1:1486585/138‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTAttgtt > 2:1486585/1‑138 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa > 2:981939/1‑75 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa > 2:1311214/1‑75 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa < 1:981939/75‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa < 1:1311214/75‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc > 1:898901/1‑118 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGc < 2:898901/118‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATc > 1:831131/1‑139 (MQ=255) aGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAg < 1:1535753/139‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTc > 2:1601417/1‑109 (MQ=255) gTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTc < 1:1601417/109‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAgg < 2:831131/139‑1 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa > 1:1117279/1‑67 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa < 2:1117279/67‑1 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa > 2:482162/1‑71 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGa < 1:482162/71‑1 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATtctc < 2:104280/98‑1 (MQ=255) ttCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATtctc > 1:104280/1‑98 (MQ=255) cGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa < 1:875895/62‑1 (MQ=255) cGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCaaaa > 2:875895/1‑62 (MQ=255) cGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAGGCATTTg < 1:1642666/139‑1 (MQ=255) cTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATa > 2:1316841/1‑106 (MQ=255) cTCGTCAAGACGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATa < 1:1316841/106‑1 (MQ=255) cGCTGTAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAGGCATTTGCGGGTTAAGCGCGATGgcag > 2:986682/1‑139 (MQ=255) tAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATtctc < 1:86955/68‑1 (MQ=255) tAATTCACCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATtctc > 2:86955/1‑68 (MQ=255) | CCCAGGGATTCACGGCGCTGCCAGACAGCATCTACCCGCGCGAATAATTCACCGTTCAGATAGATATCATTAGCCAGTTCCGCCAGTTCAGCGGAAAACTGCTCGTCAAGACGCTGTAATTCATCATTGGTATGCGCCGCAGTCATCGCAAAAAAGACGCTGGTAACGCGGGTAAGTAATTCTCCGCTTTGTTCCAGTGCCAGAATAGTATTGTTGAAATCAGGCATTTGCGGGTTAAGCGCGATGGCAG > NC_000913/1627001‑1627250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |