Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 170,349 | A→G | H191R (CAC→CGC) | fhuC → | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 170,349 | 0 | A | G | 100.0% | 198.5 / NA | 55 | H191R (CAC→CGC) | fhuC | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (27/28); total (27/28) |
CTGGCGGCGAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGATTGCTCAGGGAACGCCTGCGGAA > NC_000913/170223‑170479 | ctGGCGGCGAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCa > 1:1294102/1‑139 (MQ=255) ggcggcGAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAgg > 2:1695317/1‑139 (MQ=255) gcgAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGc > 1:791586/1‑138 (MQ=255) gcgAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGc < 2:791586/138‑1 (MQ=255) gggCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGt < 2:1138439/139‑1 (MQ=255) ccATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGtt < 1:1623645/102‑1 (MQ=255) ccATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGtt > 2:1623645/1‑102 (MQ=255) ccATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGtt > 1:1528304/1‑139 (MQ=255) aTGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGc < 2:1528304/139‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 2:1294102/139‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 1:1695317/139‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGAGATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 2:134737/139‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCAc > 2:1084435/1‑139 (MQ=255) ggtggCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGat < 1:996640/139‑1 (MQ=255) cAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAata > 1:1016419/1‑139 (MQ=255) aTAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGtt < 1:697212/84‑1 (MQ=255) aTAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGtt > 2:697212/1‑84 (MQ=255) aTAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATggc > 2:1601628/1‑139 (MQ=255) aGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATggcgg < 2:803584/139‑1 (MQ=255) gTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGc < 1:1080794/92‑1 (MQ=255) atCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGc > 2:1080794/2‑92 (MQ=255) ttGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCgtgt < 1:486375/106‑1 (MQ=255) ttGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCgtgt > 2:486375/1‑106 (MQ=255) ttGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACtgtg > 1:679254/1‑139 (MQ=255) cTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGAtt < 1:1084435/139‑1 (MQ=255) cTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCAc < 2:1019192/113‑1 (MQ=255) cTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCAc > 1:1019192/1‑113 (MQ=255) tGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCa > 1:1402030/1‑52 (MQ=255) tGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCa < 2:1402030/52‑1 (MQ=255) tGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGa < 1:1633063/66‑1 (MQ=255) tGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGa > 2:1633063/1‑66 (MQ=255) cGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa > 2:610971/1‑78 (MQ=255) cGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 1:610971/78‑1 (MQ=255) cGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGcgcg > 2:414223/1‑128 (MQ=255) cGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGcgcg < 1:414223/128‑1 (MQ=255) accaGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATg > 1:1185055/1‑134 (MQ=255) accaGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATg < 2:1185055/134‑1 (MQ=255) ccaGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGATTGCt < 2:679254/139‑1 (MQ=255) gATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa > 2:1097026/1‑65 (MQ=255) gATGTGCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 1:1097026/65‑1 (MQ=255) gtgCTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCa > 2:282201/1‑81 (MQ=255) gtgCTGTCGCTGGTGCGACGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCa < 1:282201/81‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTg < 1:772737/49‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTg > 2:772737/1‑49 (MQ=255) tGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa < 2:957683/58‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCa > 1:957683/1‑58 (MQ=255) tGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGa > 1:961785/1‑120 (MQ=255) tGTCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGa < 2:961785/120‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGAc < 1:916521/38‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGAc > 2:916521/1‑38 (MQ=255) gCTGGTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGATTGCTCAGGGAACGCCTGCGGaa > 1:1459478/1‑139 (MQ=255) ggTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGt < 1:956511/36‑1 (MQ=255) ggTGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGt > 2:956511/1‑36 (MQ=255) tGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTgcg > 1:803587/1‑97 (MQ=255) tGCGCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTgcg < 2:803587/97‑1 (MQ=255) | CTGGCGGCGAACGTCAGCGGGCGTGGATCGCCATGCTGGTGGCGCAGGATAGCCGTTGTCTGTTGCTCGACGAACCGACCTCGGCGCTGGATATCGCCCACCAGGTTGATGTGCTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATATCAATATGGCGGCACGCTACTGTGATTATCTGGTCGCCCTGCGCGGCGGTGAAATGATTGCTCAGGGAACGCCTGCGGAA > NC_000913/170223‑170479 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |