| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,504,391 | T→C | E32G (GAA→GGA) | fryA ← | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and IIA components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,504,391 | 0 | T | C | 100.0% | 210.5 / NA | 57 | E32G (GAA→GGA) | fryA | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/30); total (27/30) | |||||||||||
CGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAG > NC_000913/2504256‑2504508 | cgccgcgccTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGc > 1:1183300/1‑139 (MQ=255) gccTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGcc < 1:1439829/139‑1 (MQ=255) ctctTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGcc > 2:86961/1‑134 (MQ=255) ctctTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGcc < 1:86961/134‑1 (MQ=255) aTCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCAc < 1:217195/139‑1 (MQ=255) aaCTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACg > 2:1029369/1‑139 (MQ=255) cTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAg < 2:1279039/139‑1 (MQ=255) ttAAATAGAGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAATAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑Ta < 1:1029369/139‑1 (MQ=255) tAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACg < 1:675100/126‑1 (MQ=255) tAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACg > 2:675100/1‑126 (MQ=255) gggTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGcc < 2:1555964/87‑1 (MQ=255) gggTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGcc > 1:1555964/1‑87 (MQ=255) gggTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGtt < 2:565333/139‑1 (MQ=255) gggTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGtt > 1:1678237/1‑139 (MQ=255) gggTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGtt > 1:530192/1‑139 (MQ=255) gggTGCCAGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCa < 1:1506218/97‑1 (MQ=255) gggTGCCAGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCa > 2:1506218/1‑97 (MQ=255) ggtgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACg < 1:227355/123‑1 (MQ=255) ggtgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACg > 2:227355/1‑123 (MQ=255) gtgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGtt > 2:446301/1‑137 (MQ=255) gtgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGtt < 1:446301/137‑1 (MQ=255) gtgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAg > 2:1675451/1‑139 (MQ=255) tgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCAc > 1:197531/1‑86 (MQ=255) tgccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCAc < 2:197531/86‑1 (MQ=255) gccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCAc < 1:1322345/94‑1 (MQ=255) gccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCAc > 2:1322345/1‑94 (MQ=255) ccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGTCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCa < 1:1076772/139‑1 (MQ=255) ccggtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCa > 2:1261043/1‑139 (MQ=255) gtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAg > 1:240086/1‑139 (MQ=255) gccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGa > 2:908027/1‑139 (MQ=255) aaTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACag < 1:1675451/139‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCAc < 2:842302/79‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCAc > 1:842302/1‑79 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACg < 2:183567/98‑1 (MQ=255) cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACg > 1:183567/1‑98 (MQ=255) cAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑Ta < 2:1307009/110‑1 (MQ=255) cAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑Ta > 1:1307009/1‑110 (MQ=255) cGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTCCCCACG‑CGGACCAACATGTTAGACCG‑TAGGCAAAGGGCCGAAAAAATGaaacc > 1:1114980/1‑136 (MQ=255) gAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCg < 1:1261043/139‑1 (MQ=255) ccTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAGAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTg > 2:1033595/1‑53 (MQ=255) ccTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTg < 1:1033595/53‑1 (MQ=255) ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCggg < 2:240086/139‑1 (MQ=255) tGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGt < 2:1678237/139‑1 (MQ=255) tGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGt < 2:530192/139‑1 (MQ=255) cTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGt < 1:474229/133‑1 (MQ=255) cTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCa > 2:1369714/1‑139 (MQ=255) cTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATGGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGt > 2:474229/1‑133 (MQ=255) tGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAg < 1:908027/139‑1 (MQ=255) cGATGGTTAATAAAAGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGgag < 1:1510041/139‑1 (MQ=255) aaGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGa > 2:468636/1‑92 (MQ=255) aaGTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGa < 1:468636/92‑1 (MQ=255) gTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGc > 1:745849/1‑72 (MQ=255) gTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGc < 2:745849/72‑1 (MQ=255) gTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCa > 1:956939/1‑73 (MQ=255) gTGATTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCa < 2:956939/73‑1 (MQ=255) aTTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAAtt > 2:1637194/1‑85 (MQ=255) aTTCCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAAtt < 1:1637194/85‑1 (MQ=255) | CGCCGCGCCTGCTCTTCATCGCTGCCGCTAATGTTCAGGCTGCAACTGTCATTAAATAGGGTGCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATG‑TAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAG > NC_000913/2504256‑2504508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |