| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,176,858 | C→T | *141* (TAG→TAA) | yqiB ← | DUF1249 protein YqiB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,176,858 | 0 | C | T | 100.0% | 283.7 / NA | 86 | *141* (TAG→TAA) | yqiB | DUF1249 protein YqiB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/40); total (46/40) | |||||||||||
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tAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 1:598388/131‑1 (MQ=255) cTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGAt < 2:859806/139‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAt < 1:381162/97‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAt > 2:381162/1‑97 (MQ=255) aCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTaa > 1:1686810/1‑139 (MQ=255) ctctGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAAt < 2:1374322/139‑1 (MQ=255) 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tttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt < 2:108219/139‑1 (MQ=255) tttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt > 2:260819/1‑139 (MQ=255) tCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:1137674/139‑1 (MQ=255) tGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 1:1583797/133‑1 (MQ=255) tGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg > 2:1583797/1‑133 (MQ=255) tGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAAt > 1:1205301/1‑139 (MQ=255) 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2:878665/1‑41 (MQ=255) acgacgTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc > 1:279804/1‑55 (MQ=255) acgacgTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc < 2:279804/55‑1 (MQ=255) acgacgTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAg > 1:766034/1‑139 (MQ=255) | CCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAG > NC_000913/3176730‑3176990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |