Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,719,768 | G→A | *97* (TAG→TAA) | yiaG → | HTH_CROC1 family putative transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,719,768 | 0 | G | A | 100.0% | 270.2 / NA | 82 | *97* (TAG→TAA) | yiaG | HTH_CROC1 family putative transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/42); total (40/42) |
GGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTT > NC_000913/3719639‑3719895 | ggTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 2:712461/139‑1 (MQ=255) ttttGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCa < 1:425793/139‑1 (MQ=255) gCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTAt < 2:94653/139‑1 (MQ=255) tATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 2:1293315/128‑1 (MQ=255) tATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 1:1293315/1‑128 (MQ=255) tATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGc > 1:767623/1‑139 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCa > 1:1323365/1‑124 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCa < 2:1323365/124‑1 (MQ=255) tCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 2:615647/139‑1 (MQ=255) gCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 1:348219/139‑1 (MQ=255) gCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 2:1608816/139‑1 (MQ=255) aTGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTc > 1:60478/1‑139 (MQ=255) aTGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGACGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTc > 2:546996/1‑139 (MQ=255) ggTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt < 2:1626232/139‑1 (MQ=255) ggTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt < 2:767623/139‑1 (MQ=255) aGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtgatga > 1:128905/1‑139 (MQ=255) gAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACa > 1:925065/1‑139 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGa > 2:344572/1‑139 (MQ=255) tGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGa > 1:864270/1‑139 (MQ=255) gggAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc > 2:418393/1‑139 (MQ=255) gACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg < 1:1513109/114‑1 (MQ=255) gACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACg > 2:1513109/1‑114 (MQ=255) cgTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAcgg > 2:1343746/1‑137 (MQ=255) gTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa < 2:1697485/139‑1 (MQ=255) gTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa < 2:128905/139‑1 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 2:774387/89‑1 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 1:774387/1‑89 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAt < 2:60478/139‑1 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAt > 1:1114355/1‑139 (MQ=255) ttCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc < 1:1395874/117‑1 (MQ=255) ttCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAc > 2:1395874/1‑117 (MQ=255) ttCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAc > 2:1187430/1‑128 (MQ=255) ttCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAc < 1:1187430/128‑1 (MQ=255) cAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAcggtcctgtcatca < 1:1343746/139‑14 (MQ=255) ccGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGa < 2:357318/139‑1 (MQ=255) gAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 2:173311/1‑72 (MQ=255) gAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 1:173311/72‑1 (MQ=255) aaCTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaaa > 1:887241/1‑139 (MQ=255) aaCTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACACGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTg > 2:1028862/1‑81 (MQ=255) aaCTAAAATTGATGCGTTCGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTg < 1:1028862/81‑1 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa > 2:1732423/1‑76 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 1:1732423/76‑1 (MQ=255) tGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCa < 2:887241/139‑1 (MQ=255) cGTTTGATTCAAGCCAACACGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATc < 1:63080/139‑1 (MQ=255) gTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCa > 2:646538/1‑139 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTAta > 2:1454795/1‑53 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 1:1454795/54‑1 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc < 1:1559208/54‑1 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATc > 2:1559208/1‑54 (MQ=255) ttGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc < 2:1114355/139‑1 (MQ=255) aaGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc > 1:124284/1‑132 (MQ=255) aaGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCAcc < 2:124284/132‑1 (MQ=255) gCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGc > 1:233525/1‑139 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTa < 2:84849/92‑1 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTa > 1:84849/1‑92 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGc > 1:189719/1‑139 (MQ=255) cccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGc > 1:208629/1‑139 (MQ=255) ccGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCt < 2:189719/139‑1 (MQ=255) taagtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGca < 2:925065/139‑1 (MQ=255) agtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt < 2:1444476/54‑1 (MQ=255) agtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt > 1:1444476/1‑54 (MQ=255) agtaagCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGcaca > 1:687472/1‑139 (MQ=255) agCAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCa < 1:48671/106‑1 (MQ=255) 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cAGTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACg < 2:687472/139‑1 (MQ=255) gTTGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGt < 1:546996/139‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCaa > 1:1039153/1‑66 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCaa < 2:1039153/66‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAcc < 2:739870/68‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAcc > 1:739870/1‑68 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGa > 2:1112955/1‑86 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGa < 1:1112955/86‑1 (MQ=255) ttGATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGtt > 1:1408929/1‑139 (MQ=255) gATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAtt < 2:170448/70‑1 (MQ=255) gATGGAATAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGAtt > 1:170448/1‑70 (MQ=255) aaTAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa < 2:1734719/63‑1 (MQ=255) aaTAAACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGa > 1:1734719/1‑63 (MQ=255) | GGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTT > NC_000913/3719639‑3719895 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |