Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,619,913 | A→G | E104G (GAA→GGA) | deoB → | phosphopentomutase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,619,913 | 0 | A | G | 100.0% | 270.7 / NA | 75 | E104G (GAA→GGA) | deoB | phosphopentomutase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/37); total (38/37) |
TGGGGCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGG > NC_000913/4619778‑4620048 | tGGGGCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAAt < 1:427833/139‑1 (MQ=255) gCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGc < 2:1692753/134‑1 (MQ=255) gCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGc > 1:1692753/1‑134 (MQ=255) gCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGgtg > 1:1064339/1‑139 (MQ=255) 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1:1455803/1‑103 (MQ=255) tGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGaaaa < 2:216732/139‑1 (MQ=255) aaCGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTcc < 2:517370/139‑1 (MQ=255) aaGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAagag < 1:61399/139‑1 (MQ=255) tATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAgctg < 2:64007/139‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg > 1:565643/1‑93 (MQ=255) aTCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg < 2:565643/93‑1 (MQ=255) 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ggggAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCgg < 2:790007/139‑1 (MQ=255) | TGGGGCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCGTCTGGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGG > NC_000913/4619778‑4620048 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |