New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 788831 = | 0 (0.000) | 63 (1.220) | 36/236 | 0.3 | 95.5% | coding (7/1041 nt) coding (1149/1149 nt) |
galM galK |
aldose 1‑epimerase, type‑1 mutarotase, galactose mutarotase galactokinase |
? | NC_000913 | 3742633 = | 6 (0.120) | intergenic (‑101/‑100) | yiaJ/yiaK | transcriptional repressor for the yiaKLMNO‑lyxK‑sgbHUE operon/2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase, NADH‑dependent |
CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NC_000913/3742494‑3742771 | cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatc < 2:350983/139‑1 (MQ=255) cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatc < 1:998642/139‑1 (MQ=255) tctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcct > 1:270479/1‑137 (MQ=255) ctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctg > 1:754116/1‑136 (MQ=255) tcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGCGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcgtgt < 2:679042/139‑5 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAA‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCatcaatcctgttga > 1:204317/1‑132 (MQ=255) cgtcgcgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 2:28651‑M2/9‑1 (MQ=255) ctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTaa < 1:321832‑M2/16‑1 (MQ=255) ggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:806508‑M2/24‑1 (MQ=255) ggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:933405‑M2/24‑1 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:67356‑M2/24‑1 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 2:67356‑M2/111‑134 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGata > 2:361519‑M2/111‑139 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatata > 2:52849‑M2/109‑139 (MQ=255) gtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtaataaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAttt > 1:853037‑M2/106‑139 (MQ=255) agctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCat > 1:534970‑M2/89‑139 (MQ=255) tcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 2:573400‑M2/84‑116 (MQ=255) tcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt < 1:573400‑M2/33‑1 (MQ=255) gaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAttt < 1:361519‑M2/61‑1 (MQ=255) atatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGc > 2:209375‑M2/74‑139 (MQ=255) tatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 2:846769‑M2/73‑96 (MQ=255) tatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:846769‑M2/24‑1 (MQ=255) 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aggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 2:10272‑M2/81‑1 (MQ=255) agagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 1:52849‑M2/90‑1 (MQ=255) agagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 2:853037‑M2/90‑1 (MQ=255) gagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAgg < 2:1007702‑M2/91‑1 (MQ=255) gactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa > 2:267349‑M2/47‑127 (MQ=255) gactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 1:267349‑M2/81‑1 (MQ=255) ttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:426604‑M2/24‑1 (MQ=255) ttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:426604‑M2/41‑64 (MQ=255) gtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATg < 1:490051‑M2/103‑1 (MQ=255) tttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg > 1:309630‑M2/36‑125 (MQ=255) tttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 2:309630‑M2/90‑1 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 2:299629‑M2/90‑1 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg > 1:299629‑M2/25‑114 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCGTGGGATGAAAGTGACAttt > 2:27650‑M2/25‑139 (MQ=255) tcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACAttt > 1:1045913‑M2/25‑139 (MQ=255) cacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTg > 1:176898‑M2/24‑139 (MQ=255) cacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTg > 1:771982‑M2/24‑139 (MQ=255) caaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg < 1:569867‑M2/118‑1 (MQ=255) caaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAg > 1:393452‑M2/22‑139 (MQ=255) tgcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGtt > 2:658802‑M2/17‑139 (MQ=255) caggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTaa > 1:310747‑M2/15‑139 (MQ=255) ggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTaaaa > 2:323845‑M2/13‑139 (MQ=255) gacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 2:27361‑M2/128‑1 (MQ=255) gacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:27650‑M2/128‑1 (MQ=255) gacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:818335‑M2/128‑1 (MQ=255) gacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:793902‑M2/128‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTg > 2:928661‑M2/7‑61 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTg < 1:928661‑M2/55‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa > 1:1041388‑M2/7‑69 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 2:1041388‑M2/63‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa < 2:504268‑M2/85‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaaaaaa > 1:504268‑M2/7‑91 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa > 2:268207‑M2/7‑87 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 1:268207‑M2/81‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt < 1:903364‑M2/108‑1 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGt > 2:903364‑M2/7‑114 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 1:949129‑M2/7‑139 (MQ=255) tgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 1:287388‑M2/7‑139 (MQ=255) aCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTaa > 2:156446‑M2/2‑139 (MQ=255) aCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTaa > 2:124187‑M2/2‑139 (MQ=255) aCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTaa > 2:937222‑M2/2‑139 (MQ=255) caGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 1:323845/139‑1 (MQ=255) caGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 1:209375/139‑1 (MQ=255) | CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NC_000913/3742494‑3742771 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |