| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 693,180 | A→G | Y67H (TAT→CAT) | ybeZ ← | heat shock protein, putative NTPase, PhoH‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 693,180 | 0 | A | G | 95.1% | 132.4 / ‑2.4 | 41 | Y67H (TAT→CAT) | ybeZ | heat shock protein, putative NTPase, PhoH‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (25/14); total (26/15) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
TATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATACAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGATGTTGTCATCAAACGGGCCGC > NC_000913/693048‑693314 | tatTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCt < 1:288983/139‑1 (MQ=255) cTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCa > 2:564812/1‑139 (MQ=255) cGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGc < 2:517860/132‑1 (MQ=255) cGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGc > 1:517860/1‑132 (MQ=255) gCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGt > 2:249675/1‑139 (MQ=255) cGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGAc > 2:538229/1‑139 (MQ=255) ctctCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGc > 2:965609/1‑139 (MQ=255) ctctCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGc > 2:500641/1‑139 (MQ=255) tctcCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCa > 1:149070/1‑139 (MQ=255) tctcCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCa > 2:569871/1‑139 (MQ=255) cgcgCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATc > 2:648903/1‑139 (MQ=255) ccAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGt < 1:281501/139‑1 (MQ=255) ccAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGt < 1:290007/139‑1 (MQ=255) aCCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGtt < 1:551632/139‑1 (MQ=255) ttcttTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACgg < 1:718471/121‑1 (MQ=255) ttcttTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGAATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACgg > 2:718471/1‑121 (MQ=255) cttTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGtt > 1:183306/1‑139 (MQ=255) aaGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTa < 2:650455/70‑1 (MQ=255) aaGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTa > 1:650455/1‑70 (MQ=255) aaGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGa > 1:949743/1‑139 (MQ=255) aaGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGa > 2:908864/1‑139 (MQ=255) aaGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATATCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGa > 2:95889/1‑139 (MQ=255) aGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGAt > 2:511810/1‑139 (MQ=255) aGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATAGCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGAt > 2:714664/1‑139 (MQ=255) aTCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATATCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGAtct < 1:95889/139‑1 (MQ=255) tCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGc > 1:94776/1‑139 (MQ=255) tCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGc > 1:752807/1‑139 (MQ=255) gTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCgag > 1:1052597/1‑139 (MQ=255) gTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCgag > 1:829406/1‑139 (MQ=255) ttCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCgaga < 2:829406/139‑1 (MQ=255) cTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGGCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCg < 1:761889/139‑1 (MQ=255) gACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCtt > 2:211119/1‑139 (MQ=255) gcgcATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGAtg < 2:423095/139‑1 (MQ=255) cgcATCGGGGCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGAtgt > 1:834463/1‑139 (MQ=255) cgcATCGGGGCAGTATCGACATACAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTATAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGa > 2:468007/1‑109 (MQ=255) cgcATCGGGGCAGTATCGACATACAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGa < 1:468007/109‑1 (MQ=255) gCAGTATCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGATGTTGTCATCaa < 2:149070/139‑1 (MQ=255) tCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGa < 2:915925/51‑1 (MQ=255) tCGACATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGa > 1:915925/1‑51 (MQ=255) aCATGCAGGCTACGGAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGACACGGCGTTCGAGCTGCTTGATGTTGTCATCAAACGGGCCGc < 1:648903/139‑1 (MQ=255) aCATGCAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGAAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGCTCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGATGTTGTCATCAAACGGGCCGc > 2:695314/1‑139 (MQ=255) | TATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACATACAGGCTACGCAGAATGTCTGCCGCAGCGGTGACGCAAATCGGACGGCCGGTCAGTTTAAAGTGGTTATCGCGGCGATTGATCTCGATGCCGAGACGGCGTTCGAGCTGCTTGATGTTGTCATCAAACGGGCCGC > NC_000913/693048‑693314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |