Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 775,120 | G→A | A123A (GCG→GCA) | ybgC → | acyl‑CoA thioester hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 775,120 | 0 | G | A | 100.0% | 217.0 / NA | 66 | A123A (GCG→GCA) | ybgC | acyl‑CoA thioester hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (33/33); total (33/33) |
ACAGACTGAAATAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCGCTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGCCAT > NC_000913/774985‑775253 | actgACTGAAAGAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTGTTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACtt > 2:612197/4‑139 (MQ=255) gAAATAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGt > 1:220698/1‑139 (MQ=255) gAAATAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGt > 1:60718/1‑139 (MQ=255) aaaTAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTccc > 2:826531/1‑134 (MQ=255) aaaTAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTccc < 1:826531/134‑1 (MQ=255) aaTAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCt > 1:527233/1‑139 (MQ=255) cATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGt > 2:455874/1‑139 (MQ=255) cATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGt > 2:712221/1‑139 (MQ=255) tCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcg < 1:322641/139‑1 (MQ=255) cAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 2:60718/139‑1 (MQ=255) cAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 2:220698/139‑1 (MQ=255) cAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 1:283156/139‑1 (MQ=255) aaTGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgcg > 2:529945/1‑139 (MQ=255) aTGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc > 2:355845/1‑137 (MQ=255) aTGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 1:355845/137‑1 (MQ=255) ggCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTa > 1:908559/1‑139 (MQ=255) ggCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTa > 2:971474/1‑139 (MQ=255) ccTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACTCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCa < 1:375085/139‑1 (MQ=255) ctctTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 2:491792/126‑1 (MQ=255) ctctTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc > 1:491792/1‑126 (MQ=255) ttGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtgac < 2:80685/139‑1 (MQ=255) tGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtgact < 1:79019/139‑1 (MQ=255) ttCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACAt > 1:46220/1‑139 (MQ=255) cACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGa < 2:1001396/139‑1 (MQ=255) aCGCAACGTATTGTCAACGCCGAGTATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGaa < 1:588830/139‑1 (MQ=255) aCGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGaa < 2:932462/134‑1 (MQ=255) aCGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGaa > 1:932462/1‑134 (MQ=255) cAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGt > 1:941266/1‑139 (MQ=255) aCGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTc > 1:451692/1‑139 (MQ=255) aCGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTc > 1:214374/1‑139 (MQ=255) aCGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTc > 2:24528/1‑139 (MQ=255) gCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCt < 2:263795/139‑1 (MQ=255) gCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCt < 1:529945/139‑1 (MQ=255) agaATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATAAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAg > 2:384771/1‑139 (MQ=255) gaATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAgg > 2:612564/1‑139 (MQ=255) cTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc < 2:229727/85‑1 (MQ=255) cTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTcgc > 1:229727/1‑85 (MQ=255) ttGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtgactgac > 1:1022950/1‑104 (MQ=255) ttGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtgactgac < 2:1022950/104‑1 (MQ=255) ttGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCt < 1:334852/115‑1 (MQ=255) ttGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCt > 2:334852/1‑115 (MQ=255) ttGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCt < 2:214374/139‑1 (MQ=255) tgaaGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTa > 1:935055/1‑139 (MQ=255) aGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGt < 2:835400/134‑1 (MQ=255) aGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGt > 1:835400/1‑134 (MQ=255) aGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAAc > 2:517239/1‑139 (MQ=255) gagGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTAt < 1:24528/139‑1 (MQ=255) agGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGAt > 2:532540/1‑103 (MQ=255) agGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGAt < 1:532540/103‑1 (MQ=255) ttGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGttgattttga < 1:612197/139‑1 (MQ=255) cTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGa > 1:844328/1‑66 (MQ=255) cTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGa < 2:844328/66‑1 (MQ=255) cTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCtt < 2:127569/98‑1 (MQ=255) cTCAAAATGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCtt > 1:127569/1‑98 (MQ=255) tGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCt < 1:971474/139‑1 (MQ=255) tGAAGCCTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCt < 2:46220/139‑1 (MQ=255) ccTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGc < 2:451692/139‑1 (MQ=255) ccTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGc < 1:455874/139‑1 (MQ=255) ccTCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGc < 2:935055/139‑1 (MQ=255) tCGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGCCa < 1:384771/139‑1 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtga > 1:999283/1‑42 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGtga < 2:999283/42‑1 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTg < 2:256213/65‑1 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTg > 1:256213/1‑65 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGCCat > 1:863200/1‑139 (MQ=255) cGTGCACTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGCCat > 1:522405/1‑139 (MQ=255) | ACAGACTGAAATAACATCAATGCGTGGCACCTCTTTGGTTTTCACGCAACGTATTGTCAACGCCGAGAATACTTTGCTGAATGAAGCAGAGGTTCTGGTTGTTTGCGTTGACCCACTCAAAATGAAGCCTCGTGCGCTTCCCAAGTCTATTGTCGCGGAGTTTAAGCAGTGACTGACATGAATATCCTTGATTTGTTCCTGAAGGCTAGCCTTCTGGTTAAACTTATCATGTTGATTTTGATTGGTTTTTCAATCGCATCTTGGGCCAT > NC_000913/774985‑775253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |