| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 72,115 | G→A | *255* (TAG→TAA) | yabI → | DedA family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 72,115 | 0 | G | A | 100.0% | 69.2 / NA | 23 | *255* (TAG→TAA) | yabI | DedA family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (11/12); total (11/12) | |||||||||||
TTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATACTAACCCGTAATCCC > NC_000913/71980‑72243 | ttattTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAagag < 1:353192/139‑1 (MQ=255) gcgGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTtgtg > 1:859836/1‑139 (MQ=255) cTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa < 2:859836/139‑1 (MQ=255) cGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTTGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCt > 2:802294/1‑139 (MQ=255) tGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGCGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTAt < 2:672222/139‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACg < 2:18510/139‑1 (MQ=255) aTTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCg > 2:157639/1‑139 (MQ=255) ccACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCcgcg > 2:984560/1‑97 (MQ=255) ccACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCcgcg < 1:984560/97‑1 (MQ=255) ccACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATaa > 1:176037/1‑139 (MQ=255) cACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAg < 2:176037/139‑1 (MQ=255) atatCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGa < 1:157639/139‑1 (MQ=255) tatCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGa > 1:625314/1‑138 (MQ=255) tatCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCATGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGa < 2:625314/138‑1 (MQ=255) gATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 2:164808/1‑129 (MQ=255) gATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa < 1:164808/129‑1 (MQ=255) tatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGt > 1:719917/1‑101 (MQ=255) tatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGt < 2:719917/101‑1 (MQ=255) ttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTg > 2:686281/1‑133 (MQ=255) ttGCGCAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTg < 1:686281/133‑1 (MQ=255) cGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAAc < 1:537071/139‑1 (MQ=255) aaaGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCCGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTGCATATTAACCCg < 2:605729/139‑1 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTAATccc > 2:581774/1‑139 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTAATccc > 2:1047476/1‑139 (MQ=255) | TTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATACTAACCCGTAATCCC > NC_000913/71980‑72243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |