| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,993,856 | G→A | *73* (TAG→TAA) | ygeI → | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,993,856 | 0 | G | A | 100.0% | 88.3 / NA | 29 | *73* (TAG→TAA) | ygeI | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (16/13); total (16/13) | |||||||||||
CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAT > NC_000913/2993733‑2993985 | cacCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCaaata < 1:66155/139‑1 (MQ=255) gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATa > 2:429677/1‑139 (MQ=255) tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATa < 1:762161/139‑1 (MQ=255) aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 1:429677/139‑1 (MQ=255) aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACtttt > 2:51623/1‑139 (MQ=255) aTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTctaat > 2:208664/1‑139 (MQ=255) aCAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGTTATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAg > 2:252622/1‑139 (MQ=255) ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGt > 2:82541/1‑139 (MQ=255) tCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAAATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGAGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttca > 2:589736/1‑139 (MQ=255) aaCATGGACGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGCTAAACGATTGACCAAATAAATCATAAAGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcatt < 2:545135/139‑1 (MQ=255) aCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcattc < 1:175232/139‑1 (MQ=255) gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCaaat < 2:370025/83‑1 (MQ=255) gcgcCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCaaat > 1:370025/1‑83 (MQ=255) atatGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATaa < 1:691378/76‑1 (MQ=255) atatGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATaa > 2:691378/1‑76 (MQ=255) tCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcatt > 2:127873/1‑105 (MQ=255) tCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcatt < 1:127873/105‑1 (MQ=255) gaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt < 1:51623/139‑1 (MQ=255) gaTAATCCTAACTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGATCAAATAAATAATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt < 1:283729/139‑1 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCaa < 2:834633/133‑1 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCaa > 1:834633/1‑133 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTa > 2:180811/1‑139 (MQ=255) aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTa > 1:679170/1‑139 (MQ=255) aaTCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAAACATAACGAGATACTTTta < 2:474439/72‑1 (MQ=255) aaTCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAAACATAACGAGATACTTTta > 1:474439/1‑72 (MQ=255) aCCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACgag > 2:350182/1‑52 (MQ=255) aCCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACgag < 1:350182/52‑1 (MQ=255) aCCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAAAGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCAt > 2:667695/1‑139 (MQ=255) tGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGtat > 2:358813/1‑139 (MQ=255) | CACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAT > NC_000913/2993733‑2993985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |