| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,742,229 | (A)7→6 | coding (817/1149 nt) | cfa → | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase, SAM‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,742,223 | 0 | A | . | 100.0% | 168.1 / NA | 40 | coding (811/1149 nt) | cfa | cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (18/22); total (18/22) | |||||||||||
CTGAACGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGAAAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGGAAGACTGGCATAACTTCGGTGCT > NC_000913/1742085‑1742357 | cTGAACGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGa > 2:809925/1‑139 (MQ=255) gAACGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGaaa < 1:787531/139‑1 (MQ=255) aaCGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGaaaa > 1:577707/1‑139 (MQ=255) aaCGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGaaaa > 2:927633/1‑139 (MQ=255) tttCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATccc < 2:577707/139‑1 (MQ=255) tCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGAt < 2:284588/122‑1 (MQ=255) tCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGAt > 1:284588/1‑122 (MQ=255) tgtgGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGa < 1:922333/139‑1 (MQ=255) tgGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAACCCGATCTGAATGtt > 1:468845/1‑127 (MQ=255) tgGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGtt < 2:468845/127‑1 (MQ=255) ttCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTaataaata > 2:484455/1‑139 (MQ=255) cGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTTGATCGTAATTTGAAATCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAatata < 1:927633/139‑1 (MQ=255) tCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGtt > 2:955808/1‑109 (MQ=255) tCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGtt < 1:955808/109‑1 (MQ=255) aCCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACg > 2:501813/1‑139 (MQ=255) aTACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCctct > 2:997559/1‑139 (MQ=255) ccTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGAt < 2:644702/79‑1 (MQ=255) ccTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGAt > 1:644702/1‑79 (MQ=255) aTTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGa > 1:467131/1‑95 (MQ=255) aTTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGa < 2:467131/95‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTcc < 1:731450/108‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTcc > 2:731450/1‑108 (MQ=255) ggtggtGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTg > 2:151957/1‑139 (MQ=255) gtggtgGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGc > 1:554548/1‑139 (MQ=255) tggtggATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCt < 2:448727/139‑1 (MQ=255) gATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCt < 2:587509/134‑1 (MQ=255) gATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGATGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTATGTACGCCAGATTGCt > 1:587509/1‑134 (MQ=255) tAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATtaat > 1:737044/1‑81 (MQ=255) tAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATtaat < 2:737044/81‑1 (MQ=255) aTTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGaa < 1:484455/139‑1 (MQ=255) aaGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATcc < 2:829522/57‑1 (MQ=255) aaGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACAGATCTGAATGTTGATcc > 1:829522/1‑57 (MQ=255) gCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATg < 1:50664/139‑1 (MQ=255) cATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATgg < 1:301999/139‑1 (MQ=255) cTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTtgcctgcc < 1:179951/82‑1 (MQ=255) cTCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTtgcctgcc > 2:179951/1‑82 (MQ=255) tCCATACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGGAAGACTGGCAt < 2:554548/139‑1 (MQ=255) tACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGc > 1:542877/1‑105 (MQ=255) tACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGc < 2:542877/105‑1 (MQ=255) tACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCa > 1:177463/1‑113 (MQ=255) tACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCa < 2:177463/113‑1 (MQ=255) tACTATCGGTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGGAAGACTGGCATAACt > 1:303609/1‑139 (MQ=255) aTCGGTCCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGAGCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCGCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGCAAGACTGGCATAACTTCgg < 2:672558/139‑1 (MQ=255) gTTCG‑AAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGGAAGACTGGCATAACTTCGGTGCt < 1:997559/139‑1 (MQ=255) | CTGAACGACCAGTTTGATCGTATTGTTTCTGTGGGGATGTTCGAGCACGTCGGACCGAAAAATTACGATACCTATTTTGCGGTGGTGGATCGTAATTTGAAACCGGAAGGCATATTCCTGCTCCATACTATCGGTTCGAAAAAAACCGATCTGAATGTTGATCCCTGGATTAATAAATATATTTTTCCGAACGGTTGCCTGCCCTCTGTACGCCAGATTGCTCAGTCCAGCGAACCCCACTTTGTGATGGAAGACTGGCATAACTTCGGTGCT > NC_000913/1742085‑1742357 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |