| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,577,958 | C→T | M1M (GTG→ATG) † *460* (TAG→TAA) |
mcrC ← mcrB ← |
5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,577,958 | 0 | C | T | 100.0% | 180.2 / NA | 56 | M1M (GTG→ATG) † *460* (TAG→TAA) | mcrC mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (33/23); total (33/23) | |||||||||||
ACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAA‑‑‑‑‑GAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCAT > NC_000913/4577829‑4578091 | acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAg < 1:462903/136‑1 (MQ=255)acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAg > 2:462903/1‑136 (MQ=255)acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTcc > 2:160010/1‑139 (MQ=255)acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTcc > 2:41624/1‑139 (MQ=255)acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCACATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATAACGGGCTGTTCCATTATGAGtac > 1:682456/1‑137 (MQ=255) atCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATg > 1:702772/1‑124 (MQ=255) atCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATg < 2:702772/124‑1 (MQ=255) atCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAAtt > 2:173233/1‑139 (MQ=255) cAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATttg > 1:491285/1‑139 (MQ=255) cAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATttg > 1:686956/1‑139 (MQ=255) 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2:360342/1‑139 (MQ=255) tAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtg < 1:80616/73‑1 (MQ=255) tAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtg > 2:80616/1‑73 (MQ=255) atatTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCAttt > 2:22915/1‑64 (MQ=255) atatTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCAttt < 1:22915/64‑1 (MQ=255) atTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATttgt > 1:317304/1‑52 (MQ=255) atTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATttgt < 2:317304/52‑1 (MQ=255) tACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgt > 1:326362/1‑64 (MQ=255) tACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgt < 2:326362/64‑1 (MQ=255) tACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAA‑‑‑‑‑GAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAt < 2:30568/126‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ttCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAA‑‑‑‑‑GAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCAt > 1:163061/1‑139 (MQ=255) | ACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAA‑‑‑‑‑GAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCAT > NC_000913/4577829‑4578091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |