Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 130,233 | T→C | N343S (AAC→AGC) | yacH ← | DUF3300 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 130,233 | 0 | T | C | 100.0% | 304.5 / NA | 83 | N343S (AAC→AGC) | yacH | DUF3300 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (48/35); total (48/35) |
CCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGTTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGATCGTCGTCGTCCCAGTCGATGCTGCTG > NC_000913/130098‑130367 | ccgTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATCGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGa < 1:747320/139‑1 (MQ=255) gatgaAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGAtgtt > 2:449373/1‑139 (MQ=255) atgaAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACAATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATACTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGAtgttg > 2:685724/1‑139 (MQ=255) aTCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGAtgttg > 2:1090685/1‑115 (MQ=255) aTCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGAtgttg < 1:1090685/115‑1 (MQ=255) aTCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTa > 2:632136/1‑139 (MQ=255) aTCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTa > 1:868973/1‑139 (MQ=255) aTCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATCGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTa > 2:584632/1‑139 (MQ=255) gATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCTCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTc > 1:112894/1‑139 (MQ=255) gATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTc > 2:596526/1‑139 (MQ=255) gATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTc > 1:449852/1‑139 (MQ=255) gATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTc > 1:302178/1‑139 (MQ=255) aTAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCa < 2:302178/139‑1 (MQ=255) tAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCAc > 2:80661/1‑139 (MQ=255) ggCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGAt > 1:370038/1‑139 (MQ=255) ggCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGAt > 1:105891/1‑139 (MQ=255) 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acCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCg > 2:129212/1‑139 (MQ=255) aTTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCa < 1:332303/139‑1 (MQ=255) tACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTgc > 1:87561/1‑110 (MQ=255) tACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTgc < 2:87561/110‑1 (MQ=255) tAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCgtggt < 1:129212/139‑1 (MQ=255) gTTTGGATTGTGCCGCCATGCCATATTCTTATCAGTAAGATGCTCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGtga < 1:596526/139‑1 (MQ=255) 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tCACCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGAtcgtcgt > 1:528508/1‑139 (MQ=255) aCCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGAtcgtcgtcg > 2:416843/1‑139 (MQ=255) aCCGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGAGAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGAtcgtcgtcg > 2:666446/1‑139 (MQ=255) cGGTGATACGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCTTTGTCATGATGATGATGGTCATGATCgtcgtcgtc < 2:827728/139‑1 (MQ=255) cGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGATCGTCGTCGTCCCAGTCGa < 2:105891/139‑1 (MQ=255) cGGTTGAAATTGCTGACGTCGATATTGATGTTGTCGCCGTTGTGTTGCCAGCCATTACCGTCACGATGACCGCCATCGTGGTGATGATAATCATCATTGTCATGATGATGATGGTCATGATCGTCGTCGTCCCAGTCGa < 1:892678/139‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |