| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,923,070 | G→A | A204V (GCA→GTA) | rsmG ← | 16S rRNA m(7)G527 methyltransferase, SAM‑dependent, glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,923,070 | 0 | G | A | 100.0% | 54.1 / NA | 18 | A204V (GCA→GTA) | rsmG | 16S rRNA m(7)G527 methyltransferase, SAM‑dependent, glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (9/9); total (9/9) | |||||||||||
AGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTT > NC_000913/3922958‑3923188 | agTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCg < 2:356061/139‑1 (MQ=255) tGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc > 2:773177/1‑132 (MQ=255) tGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc < 1:773177/132‑1 (MQ=255) ttATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAAcc < 1:303396/130‑1 (MQ=255) ttATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAAcc > 2:303396/1‑130 (MQ=255) aGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATcacc < 2:924636/87‑1 (MQ=255) aGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATcacc > 1:924636/1‑87 (MQ=255) aGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAtt > 2:761503/1‑139 (MQ=255) aGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAtt > 1:953734/1‑139 (MQ=255) aaaaCCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCTGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg > 2:65135/1‑139 (MQ=255) aCCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAcc < 1:470617/139‑1 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc < 2:256661/88‑1 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc < 2:603318/88‑1 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc > 1:256661/1‑88 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGAc > 1:603318/1‑88 (MQ=255) aTGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCg < 2:261004/59‑1 (MQ=255) aTGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCg > 1:261004/1‑59 (MQ=255) aTAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCTGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCttt < 1:65135/139‑1 (MQ=255) | AGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTT > NC_000913/3922958‑3923188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |