| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,024,336 | G→A | *261* (TAG→TAA) L162L (CTC→CTT) |
tatD → rfaH ← |
quality control of Tat‑exported FeS proteins, Mg‑dependent cytoplasmic DNase transcription antitermination protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,024,336 | 0 | G | A | 100.0% | 178.1 / NA | 55 | *261* (TAG→TAA) L162L (CTC→CTT) | tatD rfaH | quality control of Tat‑exported FeS proteins, Mg‑dependent cytoplasmic DNase transcription antitermination protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (25/30); total (25/30) | |||||||||||
ATCATCCCGGCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAGAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCTTCGAACGCGCCTT > NC_000913/4024201‑4024463 | atcatcCCGGCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGt < 1:248322/139‑1 (MQ=255) ggCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAAATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGCTTGCGGaa > 1:661289/1‑139 (MQ=255) gcgcAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCTACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAAc > 1:451696/1‑139 (MQ=255) cgcAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGATTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACt > 2:94733/1‑139 (MQ=255) 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2:862458/1‑44 (MQ=255) aaaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:862458/44‑1 (MQ=255) acacTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGc > 2:980563/1‑139 (MQ=255) gTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATtaa > 2:251203/1‑68 (MQ=255) gTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATtaa < 1:251203/68‑1 (MQ=255) aTTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCTTCGAACGCGCCtt < 2:961730/139‑1 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGgag < 1:897879/80‑1 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGgag > 2:897879/1‑80 (MQ=255) | ATCATCCCGGCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAGAGTTTGCGGAACTCGGTA‑‑‑TTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCTTCGAACGCGCCTT > NC_000913/4024201‑4024463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |