| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 391,703 | (G)6→7 | pseudogene (1453/1458 nt) | yaiT → | pseudogene, autotransporter family,putative structure, Not classified, interrupted by IS3, putative flagellin structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 391,697 | 1 | . | G | 100.0% | 258.5 / NA | 76 | pseudogene (1447/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family,putative structure, Not classified, interrupted by IS3, putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (41/35); total (41/35) | |||||||||||
GAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAAC > NC_000913/391562‑391835 | gAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggt‑ggg < 1:522346/139‑1 (MQ=255) cTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑ggggggg < 1:148912/139‑2 (MQ=255) ttAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgat < 2:2442/139‑1 (MQ=255) ttAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgat < 2:360363/139‑1 (MQ=255) gATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAc < 2:114126/139‑1 (MQ=255) aTACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACATTACTGTTGCCTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAcc < 1:904985/139‑1 (MQ=255) tATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACg > 2:1425907/1‑139 (MQ=255) aTCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGt > 2:324605/1‑139 (MQ=255) cGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTaa > 2:1009332/1‑139 (MQ=255) tttAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑gggg > 2:446384/1‑111 (MQ=255) tttAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑gggg < 1:446384/111‑1 (MQ=255) aactaacGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGa > 1:793283/1‑139 (MQ=255) actaacGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTTACCGAATCTTCTGGGTGGGGGGGCTGATTTATCCTACCCCCGTAATATGGac > 1:465422/1‑139 (MQ=255) taacGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac < 2:653857/139‑1 (MQ=255) taacGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac < 1:324605/139‑1 (MQ=255) cGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggt‑g < 2:309338/99‑1 (MQ=255) cGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggt‑g > 1:309338/1‑99 (MQ=255) ggTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGc > 2:202743/1‑139 (MQ=255) gTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGct < 2:793283/139‑2 (MQ=255) cttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTaa > 2:152447/1‑139 (MQ=255) aaCATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGtt > 2:241828/1‑139 (MQ=255) aaGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa > 1:1411145/1‑139 (MQ=255) gATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 2:258345/1‑139 (MQ=255) gATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 1:202743/139‑1 (MQ=255) aTACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAcc > 2:328117/1‑82 (MQ=255) aTACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAcc < 1:328117/82‑1 (MQ=255) aTACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTACTATGGCAACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTg > 1:1012728/1‑139 (MQ=25) aCCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg > 2:3205/1‑139 (MQ=255) aCCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg > 2:717691/1‑139 (MQ=255) gATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgcc < 1:1061859/139‑1 (MQ=255) catcTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac > 2:1403943/1‑90 (MQ=255) catcTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac < 1:1403943/90‑1 (MQ=255) aCTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggt > 2:308040/1‑46 (MQ=255) aCTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggt < 1:308040/46‑1 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGGTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACtg > 1:302826/1‑139 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACtg > 1:53654/1‑139 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACtg > 1:806829/1‑139 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACtg > 2:729574/1‑139 (MQ=255) tAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACtgt > 1:274236/1‑139 (MQ=255) aaCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgat > 2:1129701/1‑52 (MQ=255) aaCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgat < 1:1129701/52‑1 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGt < 1:359891/109‑1 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGt > 2:359891/1‑109 (MQ=255) ccTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg > 2:1047182/1‑117 (MQ=255) ccTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg < 1:1047182/117‑1 (MQ=255) cTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTgccgcc < 1:729574/139‑1 (MQ=255) aGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCa < 1:258345/139‑1 (MQ=255) gTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCCTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCAc < 2:410437/139‑1 (MQ=255) tACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgccgc > 1:1179363/1‑115 (MQ=255) tACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgccgc < 2:1179363/115‑1 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAccc < 1:86398/50‑1 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTAccc > 2:86398/1‑50 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACg > 1:1279050/1‑53 (MQ=39) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACg < 2:1279050/53‑1 (MQ=39) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTGCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTgccg > 2:890428/1‑129 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTgccg < 1:890428/129‑1 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGa > 2:528366/1‑139 (MQ=255) ggTTGCGTTGACCGAAGCGACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGGGACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAATTGTGCCGCCGCCACCGAt < 1:15653/138‑1 (MQ=17) gTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGt > 2:446526/1‑52 (MQ=39) gTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGt < 1:446526/52‑1 (MQ=39) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac > 1:597250/1‑62 (MQ=255) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac < 2:597250/62‑1 (MQ=255) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTg > 2:1452067/1‑139 (MQ=255) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTg > 1:591691/1‑139 (MQ=255) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTg > 1:320404/1‑139 (MQ=255) ttGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTg > 1:1380815/1‑139 (MQ=255) gCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 2:1026544/1‑88 (MQ=18) gCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 1:1026544/88‑1 (MQ=18) cGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTaa > 2:711777/1‑139 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgattgat < 2:434843/35‑1 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCtgattgat > 1:434843/1‑35 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACTCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATc > 2:809240/1‑139 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 2:1348103/1‑85 (MQ=18) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 1:1348103/85‑1 (MQ=18) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgccgc > 2:1042594/1‑105 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATc < 1:241828/139‑1 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGACGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAAt < 1:153045/138‑1 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGACGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAAt > 2:153045/1‑138 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGATTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgccgc < 1:1042594/105‑1 (MQ=17) gACCGAATCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGGGCCGCCGCCACCGATTGTAATcac > 2:821366/1‑139 (MQ=255) aTCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGa < 2:53654/139‑1 (MQ=255) aTCTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGa < 2:806829/139‑1 (MQ=255) cTACTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGata < 1:717691/139‑1 (MQ=255) aCTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAGTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGAtata < 1:1271912/139‑1 (MQ=255) cTGGGTGGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATaa < 2:1411145/139‑1 (MQ=255) gt‑gggGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACAAAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACC‑ACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAac > 2:292888/1‑139 (MQ=255) | GAATCTAAATTAACTTCAGATACTATCGATTTAACTAACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAAC > NC_000913/391562‑391835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |