Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 2,765,463 | (TATGGCAC)6→7 | intergenic (‑310/+50) | yfjL ← / ← yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage, uncharacterized protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2765412 = | 13 (0.210) | 42 (1.190) | 27/124 | 0.2 | 91.8% | intergenic (‑259/+101) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage, uncharacterized protein |
? | NC_000913 | = 2765419 | 0 (0.000) | intergenic (‑266/+94) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage, uncharacterized protein |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAT > NC_000913/2765274‑2765544 | gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCg < 2:1013465/139‑1 (MQ=255) ttccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcac > 1:1023039‑M1/136‑139 (MQ=255) cacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtacggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactat > 1:930001‑M1/133‑139 (MQ=255) cacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactat < 1:329793‑M1/7‑1 (MQ=255) ggATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGg > 1:1334189‑M2/1‑138 (MQ=255) caaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgg > 2:631465‑M1/131‑139 (MQ=255) ttCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcac > 1:1023039‑M2/1‑135 (MQ=255) aaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagatctgagaccgccaaccgcactatggcactattgcactatggca > 2:959542‑M1/121‑139 (MQ=255) tgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg < 1:286650‑M1/1‑1 (MQ=255) acgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggc < 1:1164002‑M1/26‑1 (MQ=255) taatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactat > 1:893343‑M1/109‑139 (MQ=255) tGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGg > 2:286650‑M2/1‑115 (MQ=255) aatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg < 1:507366‑M1/32‑1 (MQ=255) gACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatgg > 2:1141475‑M2/1‑114 (MQ=255) ttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca > 2:367791‑M1/105‑139 (MQ=255) ataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca < 2:645042‑M1/43‑1 (MQ=255) atataACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactgtggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 2:1106726‑M2/1‑98 (MQ=255) tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactat > 1:1139446‑M1/88‑126 (MQ=255) tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:439625‑M1/33‑1 (MQ=255) tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatgg > 2:633256‑M1/88‑104 (MQ=255) tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactat > 2:104568‑M1/88‑94 (MQ=255) gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc < 2:1416511‑M1/53‑1 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:265890‑M1/86‑126 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca > 2:129305‑M1/86‑120 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:1212540‑M1/30‑1 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:565173‑M1/25‑1 (MQ=255) ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCg < 2:753322‑M1/54‑1 (MQ=255) aCTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCg < 2:1075650/82‑1 (MQ=255) actaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGc < 2:715731‑M1/59‑1 (MQ=255) tGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgca > 1:533851/1‑82 (MQ=255) tGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactat < 2:1139446‑M2/126‑40 (MQ=255) tGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:439625‑M2/1‑87 (MQ=255) tGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatgg < 1:633256‑M2/104‑18 (MQ=255) tGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactat < 1:104568‑M2/94‑8 (MQ=255) gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCg < 2:494065/79‑1 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCg > 2:1455639/1‑78 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccg < 1:448437‑M2/139‑55 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccg > 1:787177‑M2/1‑85 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:265890‑M2/126‑42 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcacta > 2:1212540‑M2/1‑85 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatgg > 1:565173‑M2/1‑85 (MQ=255) ccccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatcgcactatggcactatggca < 1:129305‑M2/120‑36 (MQ=255) aacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgg > 1:147303‑M1/78‑86 (MQ=255) taaggtagacacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca < 2:541579‑M1/35‑1 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt > 1:498455‑M1/72‑139 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt < 2:75109‑M1/68‑1 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAg > 1:850327‑M1/71‑128 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAg < 2:850327‑M1/58‑1 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATc < 2:794662‑M1/69‑1 (MQ=255) aaCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgat < 2:498455‑M2/139‑63 (MQ=255) aaCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatgg < 2:147303‑M2/86‑10 (MQ=255) aggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcaca > 1:1220383‑M1/68‑139 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg < 1:1146807‑M1/25‑1 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcacta > 1:869851‑M1/67‑72 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcacta < 2:869851‑M1/6‑1 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCATTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCacac < 2:996023‑M1/73‑1 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCacac < 1:151940‑M1/73‑1 (MQ=255) tAAGGTAGACACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggca > 1:541579‑M2/1‑73 (MQ=255) gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggca > 1:158379‑M1/66‑76 (MQ=255) gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg > 1:923915‑M1/66‑66 (MQ=255) gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg < 2:923915‑M1/1‑1 (MQ=255) gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt > 2:545957‑M1/66‑139 (MQ=255) aGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat > 2:507366‑M2/1‑71 (MQ=255) aGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat > 1:753322‑M2/1‑71 (MQ=255) aGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat > 1:647471‑M2/1‑71 (MQ=255) aGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat > 2:329793‑M2/1‑71 (MQ=255) ggCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatgg > 2:1146807‑M2/1‑66 (MQ=255) gCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgc < 1:341841/59‑1 (MQ=255) gCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacact > 1:1416511‑M2/1‑65 (MQ=255) gCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggca < 2:158379‑M2/76‑12 (MQ=255) taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGAt < 2:1361108‑M1/62‑1 (MQ=255) caGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttga > 1:75109‑M2/1‑62 (MQ=255) atcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg < 2:1268244‑M1/1‑1 (MQ=255) ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAacac < 2:726170‑M1/90‑1 (MQ=255) tAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgat > 1:1361108‑M2/1‑56 (MQ=255) gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta > 2:544032‑M1/49‑86 (MQ=255) aTCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGg > 1:1268244‑M2/1‑54 (MQ=255) tggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta < 2:1404552‑M1/82‑1 (MQ=255) ggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc > 2:448437‑M1/44‑139 (MQ=255) ggttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcacta < 1:1245932/47‑1 (MQ=255) ggttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacac < 1:128057‑M2/139‑91 (MQ=255) gttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:544032‑M2/86‑39 (MQ=255) tcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc > 2:410663‑M1/39‑88 (MQ=255) tcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcaca < 1:245748‑M1/72‑1 (MQ=255) caaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatgg < 1:1475193‑M1/17‑1 (MQ=255) tggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatatta > 1:1404552‑M2/1‑44 (MQ=255) tCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcaca > 2:245748‑M2/1‑38 (MQ=255) tCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 1:410663‑M2/88‑51 (MQ=255) cAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatgg > 2:1475193‑M2/1‑37 (MQ=255) cagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt < 1:1102059‑M1/74‑1 (MQ=255) cAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacact > 2:1102059‑M2/1‑28 (MQ=255) agaccgccaaccgcactatggcactatggcactatgg < 1:176661‑M1/17‑1 (MQ=255) agaccgccaaccgcactatgGCACTATG‑CACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGtt < 1:1187323‑M1/93‑1 (MQ=255) gccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt < 1:530813‑M1/68‑1 (MQ=255) gccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCa < 2:100175‑M1/124‑1 (MQ=255) ccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAg < 1:924751‑M1/58‑1 (MQ=255) ccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAg > 2:924751‑M1/15‑72 (MQ=255) agaCCGCCAACCGCACTATGgcactatggcactatgg > 2:176661‑M2/1‑20 (MQ=255) agaCCGCCAACCGCACTATGgcactatgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacagtt > 2:1187323‑M2/1‑20 (MQ=255) gCCAACCGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat > 2:530813‑M2/1‑15 (MQ=255) | GCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAT > NC_000913/2765274‑2765544 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |