| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 883,665 | IS1 (–) +9 bp | [mdfA] | [mdfA] | |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 52 (0.850) | 37/212 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 883665 = | 0 (0.000) | intergenic (‑277/‑8) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGT > NC_000913/883537‑883803 | cggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacattaaatcagtaagttggcagcatcaccGAAATtgcatg < 2:415961‑M2/11‑1 (MQ=255) aaaCTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCAggt > 2:266713‑M2/1‑136 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacattaaatcagtaagttggcagcatcaccGAAATtgcatgca > 2:577684‑M2/127‑139 (MQ=255) aCTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCAggtaa > 2:1336159‑M2/1‑134 (MQ=255) 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tcaccGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTc > 1:371769‑M2/6‑96 (MQ=255) caccGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTccc < 1:269047‑M2/64‑1 (MQ=255) caccGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTccc > 2:269047‑M2/5‑68 (MQ=255) caccGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCg > 1:176636‑M2/5‑139 (MQ=255) cGAAGAAATTGCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcag < 1:619245‑M2/139‑127 (MQ=255) agaaATTGCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt > 2:739527‑M2/1‑10 (MQ=255) agaaATTGCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt < 1:739527‑M2/66‑57 (MQ=255) gaaATTGCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattc < 2:53121‑M2/139‑131 (MQ=255) aTTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCg < 2:1101088/120‑1 (MQ=255) aTTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCg > 1:1101088/1‑120 (MQ=255) | AAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAGGCGTTACTTTTCCCTCTCTGTCTGGTGCTTTACGAATTTTCAACCTATATCGGCAACGATATGATTCAACCCGGTATGTTGGCCGTGGT > NC_000913/883537‑883803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |