Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 571,444 | G→A | *184* (TAG→TAA) | ybcL → | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor, DLP12 prophage, UPF0098 family secreted protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 571,444 | 0 | G | A | 100.0% | 229.4 / NA | 70 | *184* (TAG→TAA) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor, DLP12 prophage, UPF0098 family secreted protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (35/35); total (35/35) |
ACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGGAAAGAAAGTTATC > NC_000913/571308‑571579 | aCCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAagg < 2:448096/139‑1 (MQ=255) ttAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGagag > 1:425686/1‑139 (MQ=255) aaaGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTa > 1:795779/1‑139 (MQ=255) ggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCa < 2:652205/139‑1 (MQ=255) 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> 2:1457521/1‑94 (MQ=255) ataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCctct > 1:114514/1‑139 (MQ=255) aTCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCCAGAGGTAAGACTAACTTAAAGACCGAAGAAATACg > 1:633817/1‑95 (MQ=255) aTCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACg < 2:633817/95‑1 (MQ=255) aaCCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATg > 2:622330/1‑49 (MQ=255) aaCCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATg < 1:622330/49‑1 (MQ=255) aCCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATgag > 1:1337721/1‑108 (MQ=255) aCCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATgag < 2:1337721/108‑1 (MQ=255) cTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCa > 2:869895/1‑50 (MQ=255) cTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCa < 1:869895/50‑1 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ACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGGAAAGAAAGTTATC > NC_000913/571308‑571579 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |