| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,620,207 | G→A | *73* (TAG→TAA) | marB → | periplasmic mar operon regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,620,207 | 0 | G | A | 98.9% | 282.9 / ‑3.9 | 87 | *73* (TAG→TAA) | marB | periplasmic mar operon regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (42/44); minor base T (0/1); total (42/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.26e-01 | |||||||||||
TTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAA > NC_000913/1620074‑1620339 | ttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGt > 2:695968/1‑139 (MQ=255) tgCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCg > 1:698162/1‑139 (MQ=255) ccAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGAc > 1:1356049/1‑139 (MQ=255) aTGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACAtc > 1:1468023/1‑139 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGtt > 1:116744/1‑124 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGtt < 2:116744/124‑1 (MQ=255) cGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg < 1:1335750/139‑1 (MQ=255) tGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGCTTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg < 2:924418/139‑1 (MQ=255) tGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg > 1:715155/1‑139 (MQ=255) tGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg > 1:747048/1‑139 (MQ=255) gttgttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGc < 1:793457/139‑1 (MQ=255) gttgttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg < 2:274004/135‑1 (MQ=255) gttgttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg > 1:274004/1‑135 (MQ=255) gttgttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCt < 2:747048/139‑1 (MQ=255) ttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatt < 2:1427961/139‑1 (MQ=255) ttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatt > 2:1123405/1‑139 (MQ=255) ttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttagt > 1:739982/1‑137 (MQ=255) ccATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGGTAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCAGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACtt > 2:994844/1‑139 (MQ=255) cATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTc < 2:291404/139‑1 (MQ=255) accGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGAc > 2:54642/1‑102 (MQ=255) accGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGAc < 1:54642/102‑1 (MQ=255) gTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACg > 2:1394771/1‑139 (MQ=255) aaaTCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg < 2:1227887/99‑1 (MQ=255) aaaTCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg > 1:1227887/1‑99 (MQ=255) acaTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCaa < 1:558745/139‑1 (MQ=255) caTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCaaa < 2:1345911/139‑1 (MQ=255) caTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCaaa > 1:1345911/1‑139 (MQ=255) aTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAAt > 1:225915/1‑139 (MQ=255) tGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:1068703/139‑1 (MQ=255) tGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:1468023/139‑1 (MQ=255) tGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:959321/139‑1 (MQ=255) tGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:715155/139‑1 (MQ=255) tGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:695968/139‑1 (MQ=255) ggTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa < 1:1394771/139‑1 (MQ=255) ggTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa < 1:994844/139‑1 (MQ=255) gTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGtt > 2:948356/1‑68 (MQ=255) gTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGtt < 1:948356/68‑1 (MQ=255) gCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTcc < 2:167548/95‑1 (MQ=255) gCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTcc > 1:167548/1‑95 (MQ=255) gCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGatat > 2:1382655/1‑139 (MQ=255) tGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCg > 1:1180326/1‑67 (MQ=255) tGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCg < 2:1180326/67‑1 (MQ=255) tGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATAct > 2:954744/1‑127 (MQ=255) tGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa < 1:954744/128‑1 (MQ=255) aGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCgg < 2:1356049/139‑1 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc < 1:109659/106‑1 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc > 2:109659/1‑106 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGcc > 2:1151111/1‑131 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGcc < 1:1151111/131‑1 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATa > 2:618000/1‑139 (MQ=255) gATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATa < 1:303691/139‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAAt < 1:801988/139‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGcc > 1:605442/1‑104 (MQ=255) tCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGcc < 2:605442/104‑1 (MQ=255) cGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc > 2:1402901/1‑95 (MQ=255) cGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc < 1:1402901/95‑1 (MQ=255) tataATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 2:468489/1‑95 (MQ=255) tataATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:468489/95‑1 (MQ=255) taATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCaaa < 2:291553/91‑1 (MQ=255) taATCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCaaa > 1:291553/1‑91 (MQ=255) aTCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa < 2:254382/139‑1 (MQ=255) aTCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa < 1:1382655/139‑1 (MQ=255) tCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg < 1:855429/40‑1 (MQ=255) tCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg > 2:855429/1‑40 (MQ=255) tCAACACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAg > 2:82904/1‑139 (MQ=255) aaCACGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAc > 2:454706/1‑139 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCt < 2:198799/64‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCt > 1:198799/1‑64 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc > 2:783995/1‑76 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc < 1:783995/76‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 1:406047/1‑86 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:350961/86‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:406047/86‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 2:350961/1‑86 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 1:1387027/1‑86 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:1387027/86‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGcc > 1:107905/1‑101 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGcc < 2:107905/101‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCt > 2:769262/1‑124 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCt < 1:769262/124‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa < 2:456107/134‑1 (MQ=255) cacGCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa > 1:456107/1‑134 (MQ=255) gCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCgg > 2:131362/1‑101 (MQ=255) gCTATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCgg < 1:131362/101‑1 (MQ=255) tATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 1:1163722/1‑81 (MQ=255) tATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:1163722/81‑1 (MQ=255) tATGT‑AATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTaa > 2:424282/1‑139 (MQ=255) | TTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGT‑AGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAA > NC_000913/1620074‑1620339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |