Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,649,041 | G→A | *73* (TAG→TAA) | ydfC → | uncharacterized protein, Qin prophage |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,649,041 | 0 | G | A | 100.0% | 231.7 / NA | 71 | *73* (TAG→TAA) | ydfC | uncharacterized protein, Qin prophage |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/35); total (36/35) |
GCAGGATCTGAAATGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAGTAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGAC > NC_000913/1648909‑1649172 | gcAGGATCTGAAATGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTa > 2:432268/1‑139 (MQ=255) aTGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCt < 1:1304217/139‑1 (MQ=255) gggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTa > 1:1034524/1‑125 (MQ=255) gggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTa < 2:1034524/125‑1 (MQ=255) gggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTaa > 1:790768/1‑139 (MQ=255) ggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAg > 2:776801/1‑139 (MQ=255) ggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAg > 1:1106628/1‑139 (MQ=255) gCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAgg > 1:486988/1‑139 (MQ=255) cTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGt > 2:843105/1‑139 (MQ=255) tAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCt < 2:962000/133‑1 (MQ=255) 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2:759687/139‑1 (MQ=255) gAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCgg > 2:978100/1‑139 (MQ=255) aaaGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAAc < 1:836387/139‑1 (MQ=255) aTTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCATGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGGACTGACGGTTTAc < 1:1188733/139‑1 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCt < 2:1218690/46‑1 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCt > 1:1218690/1‑46 (MQ=255) ccAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAGGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTCCTGAAAGGatat > 1:898141/1‑139 (MQ=255) tACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTa > 2:183755/1‑44 (MQ=255) tACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTa < 1:183755/44‑1 (MQ=255) 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> NC_000913/1648909‑1649172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |