| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 199,238 | C→T | G437G (GGC→GGT) | bamA → | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 199,238 | 0 | C | T | 100.0% | 186.2 / NA | 57 | G437G (GGC→GGT) | bamA | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/28); total (29/28) | |||||||||||
GGGCTTCTTTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGCGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATG > NC_000913/199103‑199371 | gggCTTCTTTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGtgtg < 2:553357/139‑1 (MQ=255)gggCTTCTTTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGtgtg > 1:553357/1‑139 (MQ=255) cttTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTc > 2:465356/1‑139 (MQ=255) gAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAgg < 1:323159/139‑1 (MQ=255) 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1:1298436/139‑1 (MQ=255) cGGTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTc > 1:359871/1‑139 (MQ=255) ggTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTGGGTAACTAcccc > 2:1421968/1‑131 (MQ=255) ggTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAAccc < 1:1421968/131‑1 (MQ=255) ggTACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCa > 1:513900/1‑139 (MQ=255) tACTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCAcc < 1:1122666/139‑1 (MQ=255) cTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGt > 1:57333/1‑139 (MQ=255) cTGAAAGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACAAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGt > 1:315583/1‑139 (MQ=255) aaaGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTgg > 2:1324062/1‑44 (MQ=255) aaaGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTgg < 1:1324062/44‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGa < 2:206027/139‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGa < 1:199286/139‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGa < 1:1142873/139‑1 (MQ=255) aGTGGTGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATg > 2:1270444/1‑139 (MQ=255) | GGGCTTCTTTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGCGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATG > NC_000913/199103‑199371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |