| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,434,929 | C→T | A236A (GCG→GCA) | truA ← | tRNA pseudouridine(38‑40) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,434,929 | 0 | C | T | 100.0% | 265.8 / NA | 81 | A236A (GCG→GCA) | truA | tRNA pseudouridine(38‑40) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/41); total (40/41) | |||||||||||
AGCCTGAAATGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTAATATCTAC > NC_000913/2434795‑2435063 | aGCCTGAAATGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCa < 2:534934/139‑1 (MQ=255) gAAATGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGtt < 2:23359/139‑1 (MQ=255) aaaTGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTc > 1:128970/1‑139 (MQ=255) aTGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGC‑TTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGt < 2:1421656/139‑1 (MQ=255) gTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTc > 1:843223/1‑139 (MQ=255) tCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCt > 2:1439383/1‑139 (MQ=255) gAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCCGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTg < 1:904159/139‑1 (MQ=255) ttAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCa < 1:1458147/110‑1 (MQ=255) ttAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCa > 2:1458147/1‑110 (MQ=255) ttAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAActct > 1:975434/1‑139 (MQ=255) aGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGc > 1:599803/1‑139 (MQ=255) aGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGc > 2:331176/1‑139 (MQ=255) aGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGc > 2:1227418/1‑139 (MQ=255) tCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTa > 1:132809/1‑139 (MQ=255) gCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATcc > 1:1433050/1‑139 (MQ=255) cGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGc > 2:311828/1‑139 (MQ=255) 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tCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGa > 1:55594/1‑139 (MQ=255) aGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGctct > 2:1098844/1‑98 (MQ=255) aGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGctct < 1:1098844/98‑1 (MQ=255) aGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACa < 2:1433050/139‑1 (MQ=255) aGGGTAATCCACCGCGACCAGAAACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGc < 2:1383444/103‑1 (MQ=255) aGGGTAATCCACCGCGACCAGAAACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGc > 1:1383444/1‑103 (MQ=255) gggTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACaa < 2:599803/139‑1 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cAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCATCTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACa < 1:1365715/139‑1 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAAct < 2:1415830/56‑1 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAAct > 1:1415830/1‑56 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGcc > 2:1341711/1‑108 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGcc < 1:623873/108‑1 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGcc > 2:623873/1‑108 (MQ=255) cccTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGcc < 1:1341711/108‑1 (MQ=255) 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ccGCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAACAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACaa < 1:1148101/108‑1 (MQ=255) gCTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCg < 1:1227418/139‑1 (MQ=255) cTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATcc < 2:1241552/57‑1 (MQ=255) cTTTTGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATcc > 1:1241552/1‑57 (MQ=255) tttGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACa < 1:1601/102‑1 (MQ=255) tttGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACa > 2:1601/1‑102 (MQ=255) tGCCGTTGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTa < 1:167133/139‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTAATATc < 2:132809/139‑1 (MQ=255) tgctgctgcCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTAATATCt > 2:796124/1‑139 (MQ=255) ctgctgCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTAATATCTac < 2:241633/139‑1 (MQ=255) | AGCCTGAAATGTTCCGAGCATTATTCTCGTTAGTCCGCCAGAAATAGCGGGCCCATTGGCGGTTTTGGAAGATCATACCGGTCAGGGTAATCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTTTGCCGCCAGCAACTCTGCTATCCAGCTCTCCGGCTGGTTGTGGGCACCGACTTCCATCAGGCTGCCGACAATATTCCTGACCATATGATGTACAAAAGCATTCGCTTTAATATCTAC > NC_000913/2434795‑2435063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |