Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,632,915 | T→C | pseudogene (351/414 nt) | yhiL ← | pseudogene, DUF4049 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,632,915 | 0 | T | C | 100.0% | 251.3 / NA | 70 | pseudogene (351/414 nt) | yhiL | pseudogene, DUF4049 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/34); total (36/34) |
TACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCATATTTTTGTCTAATGTATTTGCTGGGGTCTTCACCTTTGAGTGTCTCCCCACATATGAA > NC_000913/3632782‑3633049 | tACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGcctcctt > 1:833738/1‑139 (MQ=255) aTTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAAt > 1:549109/1‑139 (MQ=255) aGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAg < 2:1408770/139‑1 (MQ=255) aaaaCCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGcc < 1:114689/139‑1 (MQ=255) 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1:806520/1‑112 (MQ=255) ttAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTa < 2:806520/112‑1 (MQ=255) ttAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCa > 2:838385/1‑139 (MQ=255) tAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCatg < 2:155039/126‑1 (MQ=255) tAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCatg > 1:155039/1‑126 (MQ=255) gTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCata > 1:440986/1‑80 (MQ=255) gTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCata < 2:440986/80‑1 (MQ=255) gTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCATATTTTTg > 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ttttattattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCATATTTTTGTCTa < 1:834765/110‑1 (MQ=255) ttttattattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCATATTTTTGTCTAATGTATTTGCTGGGGTCTTCACCTTTGAg < 1:1387921/139‑1 (MQ=255) ttattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAAttgtt > 1:742020/1‑61 (MQ=255) ttattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAAttgtt < 2:742020/61‑1 (MQ=255) ttattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGAt < 2:1239689/70‑1 (MQ=255) ttattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGAt > 1:1239689/1‑70 (MQ=255) tattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCa < 1:245238/92‑1 (MQ=255) tattttTATCACGTGCCTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCa > 2:245238/1‑92 (MQ=255) 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TACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCCATAATACCATTATCAAATTGTTGATTATGATCTACCCCGGGCCCATGATGCCCATATTTTTGTCTAATGTATTTGCTGGGGTCTTCACCTTTGAGTGTCTCCCCACATATGAA > NC_000913/3632782‑3633049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |