| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,923,070 | G→A | A204V (GCA→GTA) | rsmG ← | 16S rRNA m(7)G527 methyltransferase, SAM‑dependent, glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,923,070 | 0 | G | A | 100.0% | 84.5 / NA | 27 | A204V (GCA→GTA) | rsmG | 16S rRNA m(7)G527 methyltransferase, SAM‑dependent, glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (12/15); total (12/15) | |||||||||||
GTTATCTTGTTGATGCAAAAGAGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAG > NC_000913/3922937‑3923191 | gTTATCTTGTTGATGCAAAAGAGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTa < 2:772070/139‑1 (MQ=255) aTGCAAAAGAGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTANNNCAGTANAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGa < 2:43563/139‑1 (MQ=255) gCAAAAGAGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAACTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATg > 1:579432/1‑139 (MQ=255) gTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCt < 1:52617/139‑1 (MQ=255) tAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTgg > 1:355749/1‑139 (MQ=255) gTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGttt > 2:972845/1‑139 (MQ=255) ttATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCt > 1:1186320/1‑131 (MQ=255) ttATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCt < 2:1186320/131‑1 (MQ=255) ttataaaCCTTGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAt < 1:708912/135‑1 (MQ=255) aaaaCCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg < 1:386767/139‑1 (MQ=255) aaaCCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGa < 1:1301977/139‑1 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGat > 1:89080/1‑139 (MQ=255) ggTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGat > 2:1395274/1‑139 (MQ=255) cTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAtt > 1:243396/1‑114 (MQ=255) cTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGAtt < 2:243396/114‑1 (MQ=255) cAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg < 2:816879/107‑1 (MQ=255) cAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAc < 1:469881/109‑1 (MQ=255) cAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGAc > 2:469881/1‑109 (MQ=255) cAATTTTTTATGATTTTTCTGATAAAAATTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg > 1:816879/1‑107 (MQ=255) aaaaTTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAg < 1:793794/139‑1 (MQ=255) aaaaTTAAATTTTATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAg < 2:89080/139‑1 (MQ=255) tATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCgg > 2:675352/1‑87 (MQ=255) tATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCgg < 1:675352/87‑1 (MQ=255) tATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAg > 2:546502/1‑127 (MQ=255) tATTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAg < 1:546502/127‑1 (MQ=255) aTTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg > 2:1187317/1‑70 (MQ=255) aTTTACTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCg < 1:1187317/70‑1 (MQ=255) | GTTATCTTGTTGATGCAAAAGAGTGAACGTGGCGTTAAATGTAACCAGTTATATCAGTAGAAAACCTGGTTGTTGTTAACAGTCTAACCGGTCAATTTTTTATGATTTTTTTGATAAAAATTAAATTTTATTTGCTTTAATCACCACCAGATGACGTTCGCCATCCAGGGCTGGAACCTGAAGTTTAACCACTGATTCGACCTGATATTCTTCGGGCAACAAAGCGATTTCATCTTCCGGCATTTGCCCTTTCAG > NC_000913/3922937‑3923191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |