| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 983,623 | G→A | *183* (TAG→TAA) | ycbK → | M15A protease‑related family periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 983,623 | 0 | G | A | 100.0% | 355.8 / NA | 109 | *183* (TAG→TAA) | ycbK | M15A protease‑related family periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (53/56); total (53/56) | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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aGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCCATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTAGCCACGTAGTCACTTTATGCATATTGATACCGGCCCCGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 2:414703/139‑1 (MQ=255) tatTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAAc > 2:765200/1‑112 (MQ=255) tatTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAAc < 1:765200/112‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTcc < 2:635191/139‑1 (MQ=255) cgcgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCa > 1:124591/1‑139 (MQ=255) gcgcAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAg < 2:124591/139‑1 (MQ=255) 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gCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTggcgg < 2:180335/139‑1 (MQ=255) cACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:848254/36‑1 (MQ=255) cACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg > 2:848254/1‑36 (MQ=255) cACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa < 2:467211/43‑1 (MQ=255) cACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTa > 1:467211/1‑43 (MQ=255) | TCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCTGGCGG > NC_000913/983496‑983747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |