| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,024,336 | G→A | *261* (TAG→TAA) L162L (CTC→CTT) |
tatD → rfaH ← |
quality control of Tat‑exported FeS proteins, Mg‑dependent cytoplasmic DNase transcription antitermination protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,024,336 | 0 | G | A | 100.0% | 230.3 / NA | 71 | *261* (TAG→TAA) L162L (CTC→CTT) | tatD rfaH | quality control of Tat‑exported FeS proteins, Mg‑dependent cytoplasmic DNase transcription antitermination protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (33/38); total (33/38) | |||||||||||
GGCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAGAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCT > NC_000913/4024209‑4024450 | ggCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGaa < 2:343893/139‑1 (MQ=255) ccATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca < 2:737169/139‑1 (MQ=255) cATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 2:493878/139‑1 (MQ=255) cATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 1:39826/139‑1 (MQ=255) cATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 1:441736/139‑1 (MQ=255) tCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:582974/126‑1 (MQ=255) tCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 2:582974/1‑126 (MQ=255) tCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACtg < 1:449017/139‑1 (MQ=255) ccATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTa > 2:743747/1‑139 (MQ=255) tGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCttt > 1:24135/1‑139 (MQ=255) tGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCttt > 2:524019/1‑139 (MQ=255) tGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGa > 1:49983/1‑139 (MQ=255) gcACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTa < 1:471636/139‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGa < 1:387536/88‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGa > 2:387536/1‑88 (MQ=255) tGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 1:303389/1‑95 (MQ=255) tGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 2:303389/95‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCa < 1:524019/139‑1 (MQ=255) cGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 1:9705/1‑92 (MQ=255) cGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 2:9705/92‑1 (MQ=255) tGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca > 2:492247/1‑100 (MQ=255) tGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca < 1:492247/100‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:359639/83‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 2:359639/1‑83 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 2:102687/1‑83 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:102687/83‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca < 1:570466/93‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca > 2:570466/1‑93 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAAt > 2:726587/1‑129 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAAt < 1:726587/129‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCa < 1:741801/133‑1 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCa > 2:741801/1‑133 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGgagc > 1:266980/1‑139 (MQ=255) gaTGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGgagc > 1:818564/1‑139 (MQ=255) gCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCt < 2:708169/139‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGa < 1:798025/69‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGa > 2:798025/1‑69 (MQ=255) aTGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGTGGAACTCGGTATTCTTcaca < 1:631896/85‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca > 2:631896/1‑85 (MQ=255) gctggctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac > 2:702361/1‑83 (MQ=255) gctggctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 1:702361/83‑1 (MQ=255) gctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 2:656282/68‑1 (MQ=255) gctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 1:656282/1‑68 (MQ=255) gctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTAttct < 2:530827/73‑1 (MQ=255) gctgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTAttct > 1:530827/1‑73 (MQ=255) tgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCg > 2:384038/1‑64 (MQ=255) tgCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCg < 1:384038/64‑1 (MQ=255) gATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 2:132047/1‑56 (MQ=255) gATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:132047/56‑1 (MQ=255) aTGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAAt < 2:504684/139‑1 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt > 2:892192/1‑43 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGt < 1:892192/43‑1 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 2:551818/54‑1 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac > 2:892805/1‑54 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac > 1:551818/1‑54 (MQ=255) aaaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 1:892805/54‑1 (MQ=255) aaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca > 2:328951/1‑52 (MQ=255) aaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca < 1:328951/52‑1 (MQ=255) aaCACTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCt < 2:266980/139‑1 (MQ=255) acTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGa < 2:796865/76‑1 (MQ=255) acTGTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGa > 1:796865/1‑76 (MQ=255) gTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGTGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTa > 2:137078/1‑55 (MQ=255) gTTTGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGTGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTa < 1:137078/55‑1 (MQ=255) tGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac < 1:562169/44‑1 (MQ=255) tGGGATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCacac > 2:562169/1‑44 (MQ=255) gggATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca < 1:606606/42‑1 (MQ=255) gggATTGCGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTcaca > 2:606606/1‑42 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTaa > 1:822448/1‑45 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTaa < 2:822448/45‑1 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAAt > 1:373962/1‑71 (MQ=255) cGTTTTAAAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAAt < 2:373962/71‑1 (MQ=255) | GGCGCAACGAGCCAGCCCATCTGCCCCATATTTTGCAACGTATTGCGCACTGGCGTGGAGAAGATGCCGCATGGCTGGCTGCCACCACGGATGCTAATGTCAAAACACTGTTTGGGATTGCGTTTTAGAGTTTGCGGAACTCGGTATTCTTCACACTGTGCTTAATCTCTTTATTAATAAGATTAAGCAATAGCATGGAGCGAGCCTCACCATCGGGTTCGGTGAAAATGGCCTGAAAGCCT > NC_000913/4024209‑4024450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |