| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 390,693 | A→G | pseudogene (443/1458 nt) | yaiT → | pseudogene, autotransporter family,putative structure, Not classified, interrupted by IS3, putative flagellin structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 390,693 | 0 | A | G | 99.1% | 384.2 / ‑5.1 | 106 | pseudogene (443/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family,putative structure, Not classified, interrupted by IS3, putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (45/60); total (45/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACACTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATGAGACATTTGATAC > NC_000913/390557‑390825 | cAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCt > 2:854188/1‑139 (MQ=255) cTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGc > 2:65266/1‑139 (MQ=255) cTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGc > 2:441446/1‑139 (MQ=255) tatCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCTGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCgtgat > 2:430690/1‑139 (MQ=255) gTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCgtgatggtga < 2:733637/139‑1 (MQ=255) cAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGtttt < 2:374264/139‑1 (MQ=255) gTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCg > 1:366887/1‑122 (MQ=255) gTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCg < 2:366887/122‑1 (MQ=255) tGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCAc > 2:722039/1‑139 (MQ=255) cACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGa < 2:119688/139‑1 (MQ=255) cACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGa > 1:1193/1‑139 (MQ=255) cGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAAc < 1:722039/139‑1 (MQ=255) gtttCGACTACTTCTGTGCTGTCAGCCTGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTTTGTGTATATGATTTTTACACTGATCCGGTTGTTGATACACGCTGGCTTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACa < 2:106870/137‑1 (MQ=255) ggTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACa < 1:758985/139‑1 (MQ=255) cGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGc > 1:689452/1‑139 (MQ=255) gATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 2:1193/139‑1 (MQ=255) gATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 1:926939/139‑1 (MQ=255) gATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 1:65266/139‑1 (MQ=255) gATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 1:486901/139‑1 (MQ=255) aCTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAaca < 2:91069/139‑1 (MQ=255) cTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACactac < 2:527453/139‑1 (MQ=255) tGGCGGTTATTATGATCTTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATtgatgat < 1:333776/139‑1 (MQ=255) tttattaGGATCGTTGTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTa < 2:468622/138‑1 (MQ=255) tattatGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATg < 1:293240/139‑1 (MQ=255) aTCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTGACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGctct > 1:554602/1‑139 (MQ=255) aTCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa < 1:110521/100‑1 (MQ=255) aTCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa > 2:110521/1‑100 (MQ=255) ttttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa > 1:201833/1‑105 (MQ=255) ttttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa < 2:201833/105‑1 (MQ=255) ttttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTAc < 2:234970/139‑1 (MQ=255) tttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAacac < 1:241121/107‑1 (MQ=255) tttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAacac > 2:241121/1‑107 (MQ=255) ttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAAc < 2:845246/95‑1 (MQ=255) ttGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAAc > 1:845246/1‑95 (MQ=255) aTGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt > 2:826431/1‑92 (MQ=255) aTGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 1:826431/92‑1 (MQ=255) aTGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGAt < 1:609787/137‑1 (MQ=255) aTGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGAt > 2:609787/1‑137 (MQ=255) aTGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTc > 1:587042/1‑139 (MQ=255) ggTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCtt > 2:206162/1‑139 (MQ=255) aataatCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa < 1:892422/80‑1 (MQ=255) aataatCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa > 2:892422/1‑80 (MQ=255) aatCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAg < 2:587042/139‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATtgat < 1:853842/97‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATtgat > 2:853842/1‑97 (MQ=255) cTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATg < 2:771653/139‑1 (MQ=255) tGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa > 1:213825/1‑82 (MQ=255) tGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa < 2:213825/82‑1 (MQ=255) tGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATgg > 1:309674/1‑139 (MQ=255) tGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATgg < 1:233268/139‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 2:563344/78‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt > 1:563344/1‑78 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAaca < 2:59309/82‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAaca > 1:59309/1‑82 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAac < 1:907773/81‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAac > 2:907773/1‑81 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa < 2:900263/122‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa > 2:256196/1‑122 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa > 2:842183/1‑122 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa > 1:900263/1‑122 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa < 1:256196/122‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGa < 1:842183/122‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGAt > 1:88748/1‑135 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGAt < 2:88748/135‑1 (MQ=255) ggTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTg > 1:37134/1‑139 (MQ=255) gATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGt > 2:663553/1‑139 (MQ=255) atatGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTa > 2:412816/1‑139 (MQ=255) atGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa < 2:885933/64‑1 (MQ=255) atGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGaa > 1:885933/1‑64 (MQ=255) tGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAg > 2:21443/1‑98 (MQ=255) tGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAg < 1:21443/98‑1 (MQ=255) tGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAAcc < 2:213061/139‑1 (MQ=255) tGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAAcc < 1:196454/139‑1 (MQ=255) aTTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACa < 1:876946/63‑1 (MQ=255) aTTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACa > 2:876946/1‑63 (MQ=255) aTTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCaa < 1:412816/139‑1 (MQ=255) tttACACTGATGCGGTTGTTGATACACACTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGca < 1:743548/139‑1 (MQ=255) ttACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGa > 1:42099/1‑126 (MQ=255) ttACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGa < 2:42099/126‑1 (MQ=255) ttACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGcac > 1:249830/1‑139 (MQ=255) ttACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATCGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGcac < 1:36901/139‑1 (MQ=255) tACACTGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGcaca < 1:854188/139‑1 (MQ=255) tGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAacac > 1:464065/1‑63 (MQ=255) tGATGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAacac < 2:464065/63‑1 (MQ=255) aTGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATg > 1:61116/1‑81 (MQ=255) aTGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATg < 2:61116/81‑1 (MQ=255) aTGCGGTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATga < 2:249830/139‑1 (MQ=255) ggTTGTTGATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATGAGACa < 1:441446/139‑1 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa > 2:804956/1‑48 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTaa < 1:804956/48‑1 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATtgat < 1:465858/61‑1 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATtgat > 2:465858/1‑61 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACt > 1:113223/1‑88 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACt < 2:113223/88‑1 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATgag < 1:209507/130‑1 (MQ=255) tgATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATgag > 2:209507/1‑130 (MQ=255) gATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt < 1:264613/45‑1 (MQ=255) gATACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCt > 2:264613/1‑45 (MQ=255) aTACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATGAGACATTTGATAc < 1:206162/139‑1 (MQ=255) aTACACGCTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATGAGACATTTGATAc < 1:738137/139‑1 (MQ=255) | CAGCTTGATATCAGTAATTCAGTGATTCACGGTTCGATTACTTCTATGCTGCCTGGCGGTTATTATGATCGTTTTGATGCAGATGGTAATAATCTGGGTGGATATGATTTTTACACTGATGCGGTTGTTGATACACACTGGCGTGATGGTGATGTTTTCACTTTGAACATTGCTAACACTACTATTGATGATGATTATGAAGCTCTTTACTTCACTGATTCTTATAAAGATGGTGATGTAACCAAGCACACAAATGAGACATTTGATAC > NC_000913/390557‑390825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |