| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,094,275 | C→T | *289* (TAG→TAA) | insF1 ← | IS3 transposase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,094,275 | 0 | C | T | 100.0% | 82.8 / NA | 29 | *289* (TAG→TAA) | insF1 | IS3 transposase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (14/15); total (14/15) | |||||||||||
GCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTG > NC_000913/1094148‑1094378 | gCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGtt > 2:1174524/1‑139 (MQ=255) cTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 2:396729/139‑1 (MQ=255) gAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 1:149068/1‑128 (MQ=255) gAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 2:149068/128‑1 (MQ=255) ttGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTgccgc > 2:1358928/1‑139 (MQ=255) ggATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 1:1361355/95‑1 (MQ=255) ggATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 2:1361355/1‑95 (MQ=255) tgtgGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCAc < 2:984927/135‑1 (MQ=255) tgtgGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCAc > 1:984927/1‑135 (MQ=255) tgtgGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGAt < 1:1174524/139‑1 (MQ=255) tggtgAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac < 2:968933/113‑1 (MQ=255) tggtgAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTg > 2:1654050/1‑139 (MQ=255) tgatgAATTTTGGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAGTATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac > 1:968933/4‑113 (MQ=18) aTTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac < 2:1641063/107‑1 (MQ=255) aTTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac > 1:1641063/1‑107 (MQ=255) ttGTGAGTCACGATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAAGCACAtt < 1:520997/139‑1 (MQ=255) acagaCCATAAAGCGGCATTTTGTTCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTACGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGTCTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGata < 1:1099705/135‑1 (MQ=14) aGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGata < 1:935989/139‑1 (MQ=255) aaGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAaca < 2:13453/139‑1 (MQ=38) gCATTTTGATCCTACCCAGGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAacagctgt > 2:1099705/1‑134 (MQ=255) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa < 2:1415558/59‑1 (MQ=255) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 1:1415558/1‑59 (MQ=255) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac < 1:1628848/82‑1 (MQ=25) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcac > 2:1628848/1‑82 (MQ=25) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAAt < 2:845593/112‑1 (MQ=18) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAAt > 1:845593/1‑112 (MQ=18) cATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTg > 1:1667148/1‑139 (MQ=18) ttttGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCt < 1:3672/47‑1 (MQ=255) ttttGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCt > 2:3672/1‑47 (MQ=255) | GCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTG > NC_000913/1094148‑1094378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |