| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,128,134 | C→T | T99M (ACG→ATG) | murJ → | putative lipid II flippase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,128,134 | 0 | C | T | 100.0% | 246.8 / NA | 76 | T99M (ACG→ATG) | murJ | putative lipid II flippase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/38); total (38/38) | |||||||||||
CTTTGCCGAAGGGGCATTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGG > NC_000913/1128000‑1128268 | cTTTGCCGAAGGGGCATTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTc < 1:1575470/139‑1 (MQ=255) tGCCGAAGGGGCATTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCt < 2:1179979/139‑1 (MQ=255) ggggCATTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGc > 2:70642/1‑139 (MQ=255) aTTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgcc > 2:421146/1‑139 (MQ=255) ttttCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgccg < 1:70642/139‑1 (MQ=255) ttCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCa < 2:25839/139‑1 (MQ=255) ttCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCa < 2:1223141/139‑1 (MQ=255) gCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTggg < 2:793000/139‑1 (MQ=255) tGTACCGATTCTGGCGTAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTg > 2:677838/1‑132 (MQ=255) tGTACCGATTCTGGCGTAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTg < 1:677838/132‑1 (MQ=255) tGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATc > 1:419228/1‑139 (MQ=255) aTTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGa < 2:1398742/139‑1 (MQ=255) tCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCAt > 1:1244599/1‑108 (MQ=255) tCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCAt < 2:1244599/108‑1 (MQ=255) tCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGAcc > 1:1639894/1‑139 (MQ=255) atatAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGc > 1:58989/1‑139 (MQ=255) aaaGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgc < 2:1546775/100‑1 (MQ=255) aaaGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgc > 1:1546775/1‑100 (MQ=255) aaGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCAc < 2:1044735/100‑1 (MQ=255) aaGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCAc > 1:1044735/1‑100 (MQ=255) aGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCt < 2:716429/91‑1 (MQ=255) aGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCt > 1:716429/1‑91 (MQ=255) aGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGacac > 2:1282529/1‑139 (MQ=255) gTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGa < 2:379887/139‑1 (MQ=255) tGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTg < 1:1580607/96‑1 (MQ=255) tGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTg > 2:1580607/1‑96 (MQ=255) ccACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCAc < 1:1164304/84‑1 (MQ=255) ccACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCAc > 2:1164304/1‑84 (MQ=255) ccACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGGCAAATTTGc > 2:1068420/1‑139 (MQ=255) ccACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGc > 1:1449046/1‑139 (MQ=255) cACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTggg < 2:1282897/89‑1 (MQ=255) cACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTggg > 1:1282897/1‑89 (MQ=255) cACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGcc > 1:923069/1‑139 (MQ=255) aCGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGccc > 1:1586645/1‑139 (MQ=255) gcgGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTg > 1:251796/1‑139 (MQ=255) cTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagc < 2:1586645/139‑1 (MQ=255) tttGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcc < 2:58989/139‑1 (MQ=255) ttGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcca < 2:1449046/139‑1 (MQ=255) tGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGc < 2:1078599/100‑1 (MQ=255) tGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGATCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGc > 1:1078599/1‑100 (MQ=255) ctTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGc > 2:948429/1‑53 (MQ=255) ctTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGc < 1:948429/53‑1 (MQ=255) ctTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcc > 2:595115/1‑132 (MQ=255) ctTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcc < 1:595115/132‑1 (MQ=255) ttCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGc > 1:579746/1‑88 (MQ=255) ttCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGc < 2:579746/88‑1 (MQ=255) ttCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccag > 2:118463/1‑123 (MQ=255) ttCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccag < 1:118463/123‑1 (MQ=255) tCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGaca > 1:1372266/1‑97 (MQ=255) tCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGaca < 2:1372266/97‑1 (MQ=255) tCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTa > 2:1284060/1‑139 (MQ=255) cTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgccg < 2:19182/54‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTcgccg > 1:19182/1‑54 (MQ=255) cTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCg < 1:1441928/59‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCg > 2:1441928/1‑59 (MQ=255) ggCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGt < 2:260770/58‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGt > 1:260770/1‑58 (MQ=255) ggCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCt < 2:251796/139‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCt < 2:1639894/139‑1 (MQ=255) ctgctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTc > 1:1014196/1‑139 (MQ=255) gctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTg > 2:846620/1‑86 (MQ=255) gctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTg < 1:846620/86‑1 (MQ=255) gctgACACTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTccc > 1:1077743/1‑139 (MQ=255) acTTGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATc > 1:587103/1‑139 (MQ=255) tGCGCTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTg < 1:1068420/139‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGaca < 1:1081453/78‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGaca > 2:1081453/1‑78 (MQ=255) cTGGCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGa < 1:522089/139‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcc > 2:1501246/1‑100 (MQ=255) gCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGAccagcc < 1:1501246/100‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGctac > 1:440225/1‑106 (MQ=255) gCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGctac < 2:440225/106‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGAtct > 1:37709/1‑139 (MQ=255) gTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTAcc > 1:1630526/1‑114 (MQ=255) gTTGTGATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTAcc < 2:1630526/114‑1 (MQ=255) gtgATGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTgg < 1:1282529/139‑1 (MQ=255) | CTTTGCCGAAGGGGCATTTTCCCAGGCATTTGTACCGATTCTGGCGGAATATAAAAGTAAGCAGGGTGAAGACGCCACGCGGGTCTTTGTCTCTTATGTTTCTGGCCTGCTGACACTTGCGCTGGCGGTTGTGACGGTCGCTGGCATGCTCGCCGCACCGTGGGTGATCATGGTGACCGCGCCAGGCTTCGCTGACACAGCTGACAAATTTGCCCTGACCAGCCAGCTACTAAAGATTACCTTTCCCTATATCTTGCTGATCTCCCTGG > NC_000913/1128000‑1128268 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |