Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,203,224 | G→A | *67* (TAG→TAA) | croE → | e14 prophage, putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,203,224 | 0 | G | A | 100.0% | 167.2 / NA | 52 | *67* (TAG→TAA) | croE | e14 prophage, putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (26/26); total (26/26) |
TGGTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAGCAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCTGTCAGAAAAACTATCGCGGCGTTGCCGAG > NC_000913/1203109‑1203350 | tGGTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAAcc < 2:328470/139‑1 (MQ=255) gTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTc < 2:1447878/126‑1 (MQ=255) gTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTc > 1:1447878/1‑126 (MQ=255) gTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACca > 1:729730/1‑138 (MQ=255) gTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACca < 2:729730/138‑1 (MQ=255) aaTGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACg > 2:1342425/1‑139 (MQ=255) tGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGAt > 1:1171184/1‑139 (MQ=255) tGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGAt < 1:304724/139‑1 (MQ=255) cTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAg < 2:1552938/130‑1 (MQ=255) cTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAg > 1:1552938/1‑130 (MQ=255) 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ttGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGaa > 2:1329960/1‑131 (MQ=255) ttGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGaa < 1:1329960/131‑1 (MQ=255) aTACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGcc > 1:1399590/1‑139 (MQ=255) acaTCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAg < 1:1343978/139‑1 (MQ=255) aTCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTg < 1:90949/115‑1 (MQ=255) aTCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTg > 2:90949/1‑115 (MQ=255) aTCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTg > 1:1147989/1‑139 (MQ=255) tCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTgg < 2:1399590/139‑1 (MQ=255) ataagagacagtACGAAATCTGACTTGAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATGTTTAACCACAGAACGATGAATCTAATCGTAGGTAAGCATCACGTGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTgg < 1:1062943/128‑1 (MQ=255) gTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAAttttt < 2:736196/69‑1 (MQ=255) gTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAAttttt > 1:736196/1‑69 (MQ=255) gTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTgg > 2:389591/1‑135 (MQ=255) gTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTgg < 1:389591/135‑1 (MQ=255) aaTTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGaa < 1:952482/139‑1 (MQ=255) aTTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAAc > 2:26519/1‑67 (MQ=255) aTTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAAc < 1:26519/67‑1 (MQ=255) tGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTgg < 1:1215518/81‑1 (MQ=255) tGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTgg > 2:1215518/1‑81 (MQ=255) aCTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCt < 1:44008/129‑1 (MQ=255) aCTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCt > 2:44008/1‑129 (MQ=255) aCTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCTGTCAGaaaaa > 1:1484235/1‑139 (MQ=255) aCTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGACTGAGTGGTACGTGAAAGCTGTCAGaaaaa > 1:480981/1‑139 (MQ=255) aCTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGACTAACAGAACACTTTCAATATTTAACCACAAAACGATGACGCTAATCGTGGGTAAGCATGACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGCGAAAGcctgtctcttat > 2:1062943/1‑128 (MQ=255) ggATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACca < 1:20523/46‑1 (MQ=255) ggATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACca > 2:20523/1‑46 (MQ=255) ggATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAg < 2:1115383/49‑1 (MQ=255) ggATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAg > 1:1115383/1‑49 (MQ=255) gATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCt < 1:431042/100‑1 (MQ=255) gATATCTATCCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCt > 2:431042/1‑100 (MQ=255) ctatcCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAg > 2:1031753/1‑98 (MQ=255) ctatcCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAg < 1:1031753/98‑1 (MQ=255) tcCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATc > 2:681840/1‑56 (MQ=255) tcCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATc < 1:681840/56‑1 (MQ=255) tcCGAAAGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCTGTCAGAAAAACTATCGCGGCGTTGCCGAg > 2:1650052/1‑139 (MQ=255) caaGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAg > 1:1043065/2‑61 (MQ=255) aaaGATTAACAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAg < 2:1043065/61‑1 (MQ=255) | TGGTTTTCAATGGCTATAAAAAAGCCAGTTTTGTGCTGGCTAAAAAACTTGAGCAATACACATCAGGTGCAATTACGAAATCTGACTTAAGACCGGATATCTATCCGAAAGATTAGCAGAACACTTTCAATTTTTAACCACAGAACGATGAGGCTAATCGTGGGTAAGCATCACTGGAAAATAGAAAAACAGCCTGAGTGGTACGTGAAAGCTGTCAGAAAAACTATCGCGGCGTTGCCGAG > NC_000913/1203109‑1203350 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |