| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,502,011 | A→G | intergenic (+422/+92) | yjgZ → / ← insG | uncharacterized protein/IS4 transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,502,011 | 0 | A | G | 100.0% | 265.2 / NA | 74 | intergenic (+422/+92) | yjgZ/insG | uncharacterized protein/IS4 transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/38); total (36/38) | |||||||||||
CTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGT > NC_000913/4501878‑4502140 | cTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCaaaa < 1:1507638/139‑1 (MQ=255)cTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGAGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCaaaa < 2:1179577/139‑1 (MQ=255) cAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCt < 2:1026527/139‑1 (MQ=255) tAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAg < 2:1142788/133‑1 (MQ=255) tAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAg > 1:1142788/1‑133 (MQ=255) aTAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGt > 1:784456/1‑139 (MQ=255) aTAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGCCGGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTAAGTATTCCCGt > 1:285605/1‑139 (MQ=255) tACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCa < 2:97656/139‑1 (MQ=255) gCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGtt > 1:1378035/1‑128 (MQ=255) gCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGtt < 2:1378035/128‑1 (MQ=255) gCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGAt < 1:1144501/139‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATaa > 1:347314/1‑139 (MQ=255) gCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTaa > 1:602991/1‑139 (MQ=255) tGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGtt > 1:1429682/1‑139 (MQ=255) aGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCt < 2:201896/99‑1 (MQ=255) aGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCt > 1:201896/1‑99 (MQ=255) cTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGaaa < 2:784456/139‑1 (MQ=255) cTAATGGTTTTAAATTCCCCGGGCTGCGGGGAATACAAAGGCAAACAGTTAAAGATTGTTGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGaaa < 2:285605/139‑1 (MQ=255) tGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCaaaaa > 2:571287/1‑85 (MQ=255) tGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCaaaaa < 1:571287/85‑1 (MQ=255) ttAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAAc < 2:256541/103‑1 (MQ=255) ttAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAAc > 1:256541/1‑103 (MQ=255) aTCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATc > 1:710031/1‑139 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTa < 1:287686/109‑1 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTa > 2:287686/1‑109 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCt < 2:710031/139‑1 (MQ=255) cGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATg < 2:297952/117‑1 (MQ=255) cGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATg > 1:297952/1‑117 (MQ=255) cGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTg > 1:781067/1‑139 (MQ=255) cTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCt > 2:1354128/1‑75 (MQ=255) cTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCt < 1:1354128/75‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTaa > 1:1141059/1‑106 (MQ=255) cTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTaa < 2:1141059/106‑1 (MQ=255) cGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATa > 2:78630/1‑120 (MQ=255) cGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATa < 1:78630/120‑1 (MQ=255) cGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCAt < 2:453963/125‑1 (MQ=255) cGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCAt > 1:453963/1‑125 (MQ=255) gggCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATg < 2:602991/139‑1 (MQ=255) cAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTg > 1:1004236/1‑120 (MQ=255) cAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTg < 2:1004236/120‑1 (MQ=255) aaCAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCa > 2:283305/1‑67 (MQ=255) aaCAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCa < 1:283305/67‑1 (MQ=255) aCAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGc > 1:480451/1‑90 (MQ=255) aCAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGc < 2:480451/90‑1 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCa < 1:1317600/66‑1 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCa > 2:1317600/1‑66 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGaaa < 2:671709/96‑1 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGaaa > 1:671709/1‑96 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgac > 1:1267099/1‑139 (MQ=255) tCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgac > 2:606229/1‑139 (MQ=255) cAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATtct > 1:215566/1‑53 (MQ=255) cAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATtct < 2:215566/53‑1 (MQ=255) aTTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGctc < 2:1429682/139‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTgg > 1:648181/1‑50 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTgg < 2:648181/50‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCa > 2:469571/1‑56 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCa < 1:469571/56‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGa > 1:1209119/1‑58 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGa < 2:1209119/58‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTg < 1:847320/103‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTg > 2:847320/1‑103 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc < 1:1233601/114‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 2:1233601/1‑114 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc < 1:225538/114‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 2:225538/1‑114 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGtt > 2:1075035/1‑118 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGtt < 1:1075035/118‑1 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtttt > 1:1236430/1‑139 (MQ=255) tgGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtttt > 2:11788/1‑139 (MQ=255) ttGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc < 1:419614/109‑1 (MQ=255) ttGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 2:419614/1‑109 (MQ=255) tGACGGTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCgggg < 2:1236430/139‑1 (MQ=255) ggTCAGTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCtgt < 2:781067/139‑1 (MQ=255) gTCTTGGGGGCAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGt < 2:1267099/139‑1 (MQ=255) | CTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGT > NC_000913/4501878‑4502140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |