| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,759,680 | (C)5→6 | coding (844/1221 nt) | sufS ← | cysteine desulfurase, stimulated by SufE, selenocysteine lyase, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,759,675 | 1 | . | C | 100.0% | 125.2 / NA | 36 | G283G (GGC→GGG) | sufS | cysteine desulfurase, stimulated by SufE, selenocysteine lyase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (21/15); total (21/15) | |||||||||||
GGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCA > NC_000913/1759541‑1759796 | gggCCTTAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑‑cccc < 1:430418/139‑1 (MQ=255) tGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGgtg > 1:229142/1‑139 (MQ=255) ccGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCgg > 1:183670/1‑139 (MQ=255) tCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGc > 2:178751/1‑139 (MQ=255) cAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCa > 2:1154185/1‑139 (MQ=255) tAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCttt < 2:1124360/139‑1 (MQ=255) cgcATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGt > 2:248553/1‑139 (MQ=255) aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGc > 1:490570/1‑127 (MQ=255) aTGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGc < 2:490570/127‑1 (MQ=255) tGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTa < 2:183670/139‑1 (MQ=255) tGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:116968/115‑1 (MQ=255) tGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 2:116968/1‑115 (MQ=255) cATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGc < 1:248553/139‑1 (MQ=255) aCTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGa > 2:423481/1‑139 (MQ=255) gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt < 1:19331/103‑1 (MQ=255) gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCt > 2:19331/1‑103 (MQ=255) gCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGATATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTg > 1:712506/1‑139 (MQ=255) ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAcc > 2:485694/1‑139 (MQ=255) ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAcc > 1:1132529/1‑139 (MQ=255) ccccAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAAcc > 2:374089/1‑139 (MQ=255) aGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGcc > 2:972016/1‑77 (MQ=255) aGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGcc < 1:972016/77‑1 (MQ=255) gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATg > 1:1056661/1‑79 (MQ=255) gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATg < 2:1056661/79‑1 (MQ=255) gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑‑cccc > 2:858351/1‑45 (MQ=255) gcgcCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑‑cccc < 1:858351/45‑1 (MQ=255) tACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc < 2:1059385/111‑1 (MQ=255) tACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGc > 1:1059385/1‑111 (MQ=255) tACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAcggc > 2:171730/1‑139 (MQ=255) tCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACggcggc < 1:485694/139‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGCCCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCa > 2:15771/1‑139 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAc < 2:373947/131‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCAc > 1:373947/1‑131 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCAt < 2:1132529/139‑1 (MQ=255) aGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCa < 1:609326/137‑1 (MQ=255) aGCGCCGCGCCAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCa > 2:609326/1‑137 (MQ=255) gccgcgccAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTcc < 2:229142/139‑1 (MQ=255) gccgcgccAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTcc < 2:629506/139‑1 (MQ=255) cgccAAGACCAATGATGC‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGca > 1:269723/1‑139 (MQ=255) | GGGCCATAGAGAGTGAGATCCGGTACAGATTCCAGCTGTGATAGCGCATAATGCATCAGATTCTGTTCATACTCGGCTATGTTATTAAGCCCCAGCGCCGAAACATACTCCAGCGCCGCGCCAAGACCAATGATG‑‑CCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCACTCAGGCTGACGGTGGCGATCATAGAACCGCCCCCTTCCCACGGCGGCATCTCCTGCA > NC_000913/1759541‑1759796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |