| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,410,230 | (A)6→7 | intergenic (+279/‑50) | prmA → / → dusB | methyltransferase for 50S ribosomal subunit protein L11/tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,410,224 | 1 | . | A | 100.0% | 240.9 / NA | 73 | intergenic (+273/‑56) | prmA/dusB | methyltransferase for 50S ribosomal subunit protein L11/tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base A (44/29); total (44/29) | |||||||||||
TTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGC‑AAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCGCCCATGGCTGGCATTACAGACAGACCTTTTCGG > NC_000913/3410092‑3410357 | ttGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGC‑aaaaaa < 2:762576/139‑1 (MQ=255) gtgtAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGC‑aaaaaaatgc > 2:954474/1‑135 (MQ=255) aGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTa < 2:44521/131‑1 (MQ=255) aGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTa > 1:44521/1‑131 (MQ=255) 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atgatTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATg > 1:835569/1‑139 (MQ=255) atgatTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATg > 1:860511/1‑139 (MQ=255) tttttATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCa < 2:860511/139‑1 (MQ=255) aTGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCt > 1:128153/1‑139 (MQ=255) tGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATAcg < 1:923164/108‑1 (MQ=255) tGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATAcg > 2:923164/1‑108 (MQ=255) 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2:370138/1‑77 (MQ=255) tctcAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATAcg < 1:1049903/60‑1 (MQ=255) tctcAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATAcg > 2:1049903/1‑60 (MQ=255) tctcAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACTCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAg > 2:128379/1‑139 (MQ=255) tctcAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAATATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAg < 2:798062/139‑1 (MQ=255) ctcAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAgc > 1:1053041/1‑139 (MQ=255) aTTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCGCCCAtgg > 2:425130/1‑139 (MQ=255) ttGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAg > 1:56870/1‑67 (MQ=255) 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(MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCAt < 2:1196770/93‑1 (MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCAt > 1:1196770/1‑93 (MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGAc > 1:911843/1‑98 (MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGAc < 2:911843/98‑1 (MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCGCCCAtggct > 2:77916/1‑139 (MQ=255) tGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCGCCCAtggct > 2:779258/1‑139 (MQ=255) gTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCa < 1:354830/57‑1 (MQ=39) gTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCa > 2:354830/1‑57 (MQ=39) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |