Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,403,912 | C→T | V218V (GTG→GTA) | abgA ← | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, A subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,403,912 | 0 | C | T | 100.0% | 142.8 / NA | 44 | V218V (GTG→GTA) | abgA | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, A subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (21/23); total (21/23) |
CAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACCTTCCTCTGCAGGCTGAAAAATCAGTTTGATGACG > NC_000913/1403782‑1404047 | cAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGcc < 2:337606/139‑1 (MQ=255) tGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGcc < 1:650309/133‑1 (MQ=255) tGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGACAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGcc > 2:650309/1‑133 (MQ=255) gCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGt > 2:655646/1‑138 (MQ=255) gCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGt < 1:655646/138‑1 (MQ=255) gCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTa > 1:671145/1‑139 (MQ=255) gCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTa > 1:722251/1‑139 (MQ=255) tgtgCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGc < 2:671145/139‑1 (MQ=255) tgctgcCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAgg > 2:659155/1‑132 (MQ=255) tgctgcCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAgg < 1:659155/132‑1 (MQ=255) cgtcaacaaGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCa < 1:744777/136‑1 (MQ=255) cgccAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCa < 1:980046/139‑1 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCa > 2:524240/1‑126 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCa < 1:524240/126‑1 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACgg < 1:735948/129‑1 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACgg > 2:735948/1‑129 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACAGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAaata > 2:918767/1‑139 (MQ=255) tcttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGt > 1:660673/1‑105 (MQ=255) tcttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGt < 2:660673/105‑1 (MQ=255) cttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATc > 1:160336/1‑139 (MQ=255) cgcCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc < 2:722251/139‑1 (MQ=255) cgcCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACAGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc < 1:918767/139‑1 (MQ=255) cGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCCCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACAcc < 1:571001/139‑1 (MQ=255) aGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCa > 2:752748/1‑139 (MQ=255) cggTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAca > 1:536457/1‑116 (MQ=255) cggTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAca < 2:536457/116‑1 (MQ=255) cggTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc < 2:225299/124‑1 (MQ=255) cggTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc > 1:225299/1‑124 (MQ=255) aGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCcgcgc > 2:641616/1‑139 (MQ=255) gcgcGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGccc < 1:478903/56‑1 (MQ=255) gcgcGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGccc > 2:478903/1‑56 (MQ=255) gcgcGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGcc > 1:1045734/1‑139 (MQ=255) cgcgTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCa > 2:760614/1‑139 (MQ=255) cgcgTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCa < 1:641616/139‑1 (MQ=255) cgTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATc > 1:94819/1‑94 (MQ=255) cgTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATc < 2:94819/94‑1 (MQ=255) cAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGt < 1:752748/139‑1 (MQ=255) aaaTTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTa < 1:760614/139‑1 (MQ=255) aTTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCAc < 1:830622/73‑1 (MQ=255) aTTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCAc > 2:830622/1‑73 (MQ=255) gCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAaataa > 2:430406/1‑75 (MQ=255) gCCATAAAATTATCACTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAaataa < 1:430406/75‑1 (MQ=255) cTGCCGCACACTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACCTTCCTCTGCAGGCTGAAAAATCAGtt > 1:1160284/1‑139 (MQ=255) acacTACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACCTTCCTCTGCAGGCTGAAAAATCAGTTTGATGAc < 2:160336/139‑1 (MQ=255) cactacGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACCTTCCTCTGCAGGCTGAAAAATCAGTTTGATGACg < 2:808982/139‑1 (MQ=255) | CAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACCTTCCTCTGCAGGCTGAAAAATCAGTTTGATGACG > NC_000913/1403782‑1404047 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |